Figtree tutorial - Apuntes Final PDF

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Tutorial para producción de árboles filogenéticos en FIGTREE
Profesor: David Arturo Paz...

Description

Universidad Autónoma de Baja California Sur Área de Conocimiento de Ciencias del Mar y de la Tierra Departamento Académico de Ciencias Marinas y Costeras Sistemática integrativa Recuperación de secuencias nucleares y mitocondriales y MEGA La Paz, B.C.S., a 03 de octubre del 2017

Artículo: Filogenia multilocular y radiación rápida reciente de las serpientes de mar vivíparas (Elapidae: Hidrophiinae)

1. Descragar FigTree.

2. Se usa el árbol filogenético exportado anteriormente.

3. Se usa el formato Newick.

4. Se selecciona el archivo y se abre y da una pestaña por los bootstraps.

5. Ya con el nombre de bootstraps.

6. Se cambian los ajustes para cómo se muestran los boostraps y la barra de color de acuerdo al porcentaje de veracidad del árbol.

7. Luego en legend se cambian las opciones de los textos de acuerdo a los bootstraps.

8. Grosor de las líneas se modifica en apariencia.

9. Organizar de clados antiguos a recientes con la opción de ordenar de menor a mayor o mayor a menor.

10. Organizar el árbol mediante el punto medio (organismos más viejo y más joven y se saca la medida de ello) de las opciones.

11. Cambio de color de un clado o nodo seleccionando la zona y cambiando el color.

12. Editar el árbol para obtener colores y grupos deseados.

13. Guardar archivo en formato PDF con el nombre deseado....