Informe de Sistematica - Miguel Angel Stand Perez PDF

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Para esta práctica de laboratorio se realizó un análisis filogenético del género Listroderes (Coleptera: Curculionidae). Se utilizaron los softwares cladisticos WinClada y TNT para construir una hipótesis filogenéticacon análisis heurístico, un árbol de consenso estricto, los índi...

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MEDIDAS DE AJUSTE Y SOPORTE Sistemática 2017-I 1

Miguel Ángel Stand Perez1 Estudiante de Biología, Facultad de Ciencias Básicas, Universidad del Atlántico.

Para esta práctica de laboratorio se realizó un análisis filogenético del género Listroderes (Coleptera: Curculionidae). Se utilizaron los softwares cladisticos WinClada y TNT para construir una hipótesis filogenética con análisis heurístico, un árbol de consenso estricto, los índices de consistencia, retención y consistencia reescalado, además de las medidas de soporte (Bootstrap, remuestreo simétrico, Jackknife y Bremer); utilizando el método de optimización de Fitch. Cabe destacar que estas mediadas de soporte de grupos no son excluyentes, ninguna tiene mayor importancia o valor que otra, por el contrario son datos complementarios que se deberían calcular simultáneamente en los trabajos filogenéticos. El análisis heurístico arroja un total de 3838 árboles, para acciones didácticas se escogió la primera hipotesis (Figura 1), mostrando grupos relacionados por plesiomorfias: (L. bruchi, L. punicola, L. pusillus); (L. angulipenis, L. delaiguei); (L. affinis, L. brevisetis, L. howdenae). El índice de retención para el primer árbol del análisis heurístico es de 54%, queriendo decir que se presentan una buena cantidad de sinapomorfias, mientras que el índice de consistencia es del 43%, indicando así un grado de homoplasias relativamente bajo (inferior al 50%).

Figura 1. Primera hipótesis del análisis heurístico.

Una vez realizado el consenso estricto se obtiene una politomia de todo el grupo interno (Listroderes) (Figura 2.) Debido a la gran cantidad de hipótesis resultantes del análisis, estando resuelta solo la relación (L. brevisetis, L.howdenae), pero no así su posición en el

género. Si la pregunta de investigación fuese comprobar la monofilia de Listroderes, este análisis sería suficiente, pero si al contrario se quiere resolver las relaciones internas, se debe analizar de nuevo los caracteres y su polarización además de agregar más caracteres.

Figura 2. Árbol consenso estricto de Listroderes.

Al calcular la medida de soporte de Bootstrap realizando un total de 100 réplicas (Figura 3.), se obtienen resultados superiores al 50% aunque con una cantidad considerable de politomias en la hipótesis, cabe recalcar que el valor del grupo interno es de 100% y con un menor valor en los grupos más derivados (L. scylla, L. confusus, L. affinis, L. brevisetis, L. howdenae), estos últimos dos con un valor alto (98%). Al compararlo con la medida de soporte de Jackknife (Figura 4), se obtienen valores muy cercanos, pero con igual cantidad de politomias. Con la medida de soporte de Bremer (Figura 5), el resultado es muy distinto pues solo arroja un valor de 50% para todo el género Listroderes (mostrando una politomia del grupo interno). Mientras que haciendo un remuestreo simétrico (Figura 6), se obtiene un valor superior al 100% en el grupo interno, pero en las diferentes politomias se presentan valores inferiores al 50% (rondando entre 2 y 11%) indicando que son clados poco soportados que necesitan mejor revisión.

Figura 3. Árbol con medida de soporte Bootstrap.

Figura 4. Árbol con medida de soporte Jackknife.

Figura 5. Árbol con medida de soporte de Bremer.

Figura 6. Árbol con medida de soporte de Remuestreo simétrico....