Practica 1 v1 1718 mapa distribucion una especie PDF

Preview

Summary

Práctica 1 de Botánica...

Description

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie. Resumen El objetivo de esta práctica es que el alumno aprenda a descargar datos de GBIF/BIOCASE, que adquiera un manejo básico de la proyección de los mismos, utilice capas vectoriales y realice diseños de mapas.

Introducción y objetivos El alumno deberá descargar datos georreferenciados y procesar la información en un sistema de información geográfica. Nos planteamos un único objetivo: 1. Realizar el mapa con la distribución de una especie. Se entregarán dos archivos: 1. Memoria con el resumen de la práctica (ver contenidos y criterios de calificación). 2. Mapa con la distribución de la especie…….. (a elegir por el alumno)

Materiales y aplicaciones Las aplicaciones a utilizar son Excel2010 (en el aula TIC del aulario Severo Ochoa) y QGis …. Datos necesarios:  

Shapefiles de todos los países del mundo, descargables desde DERA (IECA). Tabla de datos procedentes de BIOCASE o de GBIF (www.datos.gbif.es). En este tutorial se utilizarán los referentes a la especie Olea europaea y se podrá comparar el resultado obtenido en ambos casos.

Metodología Para iniciar: es IMPORTANTE que organicemos la información. RECOMENDACIÓN: habilitar un directorio de trabajo con  Una carpeta para guardar las capas según procedencia. Esta información tiene el carácter de diccionario y no se modifica, salvo en el caso de descargar una actualización de la misma.  Una carpeta para los archivos generados en cada práctica. El proceso a seguir es el siguiente: 1. Acceso y descarga de registros desde 1.1. www.datos.gbif.es 1.2. Biocase.org 2. Transformación de los datos obtenidos en formato de “texto delimitado”. El proceso es diferente según se trate de GBIF o de BIOCASE. 2.1. CASO GBIF 2.1.1.En la aplicación Excel/nuevo libro en blanco, 2.1.2.Pestaña DATOS, obtener datos externos de tipo texto. 2.1.3.Indicar que los datos están separados con “,” y proceder a su separación. 1

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

2.1.4.La tabla resultante, GUARDAR COMO tipo de archivo CSV (MsDos). 2.1.5.Aceptar el mensaje que los datos se situarán en una sola hoja, y rechazar el resto de mensajes. Abandonar Excel sin guardar cambios. 2.2. CASO DEL PORTAL BIOCASE. Se abre directamente el archivo y se continua con el mismo procedimiento. 3. Proyección de los datos georreferenciados en un SRC (DATUM) determinado, en nuestro caso se configura en EPSG 4326 (WGS84). 3.1. En la aplicación QGis, establecemos el SRC del proyecto en EPSG 4326 (WGS84). 3.2. Añadimos información vectorial para dar cobertura a los datos que vamos a proyectar. Utilizaremos capas con límites de los países del mundo: DERA/G20_MUNDO/ md09_paises.shp. Sus metadatos son los siguientes: Mapa digital vectorial de las divisiones administrativas del mundo (md09_paises). 2503-2013. Elaborado por Natural Earth (http://www.naturalearthdata.com/) con el apoyo de NACIS(Sociedad Norteamericana de Información Cartográfica). Proporcionado por DERA (Instituto de Estadística y Cartografía de Andalucía). Resolución espacial 1:100.000 aproximadamente. Sistema de referencia EPSG: 4326 – WGS84 /Geographic Coordinate. 3.3. Proyección de los datos Añadir capa de texto delimitado. . Es fundamental que el sistema reconozca las dos coordenadas para que el dato se pueda proyectar 3.3.1. GBIF 3.3.2. BIOCASE 4. Elaboración de resultados. 4.1. Mapa de distribución de Olea europaea. Se recomienda consultar el tutorial de mappinggis : (http://mappinggis.com/2015/06/como-crear-una-composicion-de-mapa-conqgis/http://mappinggis.com/2015/06/como-crear-una-composicion-de-mapa-con-qgis/) El diseño debe ajustarse a los siguientes puntos de control: Imagen gráfica con los registros de la especie (2 puntos) - Nombre del alumno (1punto) - Nombre de la asignatura y referencia al numero de práctica (1punto) - Fecha de realización(1punto) - Metadatos o referencia de las capas de información (3 puntos). Cada capa usada en el mapa debe llevar los siguientes datos - NOMBRE DE LA CAPA - AÑO DE PUBLICACION DEL METADATO - AUTOR - LUGAR DE PUBLICACION (puede ser dera/ieca, rediam...etc) - SISTEMA DE REFERENCIA (SRC) - RESOLUCION ESPACIAL (ESCALA) - Escala gráfica (1punto) - Leyenda (1punto). Debe reflejar claramente los elementos que componen la imagen gráfica.

5. Conclusiones. Con los resultados obtenidos se redactan unas conclusiones que, a modo de ejemplo, podría ser : El mapa representa la distribución de según datos proporcionados por

refieren a

en la consulta del dia ………….. La mayor densidad de observaciones se . 2

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

DEMOSTRACIÓN 1. Acceso a los portales suministradores de información 1.1. Ejemplo de búsqueda en BIOCASE:

3

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

En pocos segundos se descargará el archivo de datos: alldataf6b4378a79_09_11_16.xls

4

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

1.2. Ejemplo de búsqueda en www.datos.GBIF.es

Escribimos el nombre de la especie

Para descargar todos los registros

5

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

Procedemos a descargar los datos ofrecidos en la consulta:

OLEA alldataf6b4378a79_09_11_16 gbif

Los datos proporcionados por GBIF aparecen en dos archivos: tabla de texto separados por caracteres (OLEA alldataf6b4378a79_09_11_16 gbif.csv) y archivo de metadatos con relación de los campos de la tabla (readme.htlm). readme.htlm Archivo que permite conocer el significado de cada columna de la tabla que se ha descargado de GBIF.

Particularmente, estamos interesados en los campos: Catalog Nu: número de registro en la colección Scientific: nombre científico que incluye genero+especie+autor. Class: categoría taxonómica de rango superior Order: categoría taxonómica Family: categoría taxonómica Genus: categoría taxonómica Institutio: Institución que proporciona el dato, puede ser universidad, museo, herbario, etc Collector: nombre de los recolectores/y/o/identificadores del registro Event Date: fecha de la elaboración del registro en la colección Basis Of_1: tipo de registro (procede de observación, ejemplar conservado en colección)

6

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

2. Transformación de los datos en formato de “texto delimitado”. PROCESO DE TRANSFORMACION DE LOS DATOS, Se trabaja con la hoja de cálculo EXCEL. Son diferentes los procesos según se trate de GBIF o de biocase.

2.1.

DATOS DE GBIF.

Abrimos un archivo nuevo/libro en blanco

7

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

8

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

9

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

NO GUARDAR CAMBIOS

2.2.

DATOS DE BIOCASE.

Abrir directamente el archivo y guardar como CSV (msDos)

No guardar cambios

10

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

3. Proyección de los datos georreferenciados en EPSG 4326 en la aplicación QGis

Añadimos la capa md09_paises.shp

11

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

3.3.1. Proyección de los datos GBIF: Añadir capa de “texto delimitado”

12

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

Descartamos los errores originados por definiciones no validas de geometría,

3.3.2. Proyección de los datos BIOCASE: Añadir capa de “texto delimitado” Se obteienen los errores de proyección

13

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

4.- Elaboración de resultados. Mapa de localización de Olea europea según datos de BIOCASE. 4.1. Añadir los elementos obligatorios: textos para identificar el mapa, escala y leyenda. 4.2. Añadir otros elementos. De forma opcional (pues no se ha explicado en el aula) se pueden realizar: 4.2.1. Añadir imágenes (detalle de la flor de Olea europaea). 4.2.2. Añadir cuadrícula de coordenadas. 4.2.3. Añadir flecha del norte geográfico.

4.1.1 Nuevo diseñador

AÑADIR MAPA NUEVO 14

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

con el boton de mover el contenido se centra la imagen en el mapa

15

Práctica 1. Mapa de distribución de una especie Informática. Módulo 1: Sistemas de Información Geográfica. Grado de biología. Curso 2017-2018. J.Mª. Nieto*; E. Bañares*; O. Comino**; Y. Gil***; P. Navas*** *Dpto. Biología Vegetal. Botánica. Fac. de Ciencias. Univ. Málaga. ** Estudios Flora y Vegetación (EFYVE) Málaga. *** Red Información Ambiental de Andalucía (REDIAM)

Para añadir los elementos obligatorios, accedemos al menu diseño :

El mapa resultante tendría estos elementos obligatorios

5.- Conclusión. El mapa representa la distribución de Olea europea según datos proporcionados por BIOCASE en la consulta del dia 2016-11-09. La mayor densidad de observaciones se refieren a la península Ibérica (España y Portugal).

16...