Resumenes IB Bloque 1 y 2 PDF

Title Resumenes IB Bloque 1 y 2
Author Jair Colón
Course Informática Biomédica I
Institution Universidad Nacional Autónoma de México
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Resumen de la materia de IB 1...


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CAPÍTULO PRIMERO. ¿Qué es la Informática Biomédica? Para establecer una definición integradora de IB, varios autores han propuesto la utilidad de considerar categorías de definiciones: Definiciones orientadas a la tecnología de la información: hace énfasis en las computadoras y en las tecnologías como herramienta. Tiene dos consecuencias negativas: lleva a introducir el uso de las computadoras en todos los puntos posibles para resolver problemas en medicina, cambiando el objetivo de mejorar la calidad de la atención médica por el de computarizar el sistema de salud. (Computación en medicina, computación clínica) Definiciones basadas en roles tareas o dominios: se centra en la función de la informática dentro de las organizaciones. Tiende a fragmentar la disciplina de la IB y sus interacciones entre los componentes del equipo de salud. (Informática de enfermería, informática clínica) Definición orientada a conceptos: Basada en modelos conceptuales específicos. IB es la ciencia de la información (datos + significado). Se usará la definición de AMIA, la cual dice que la IB es: el campo científico interdisciplinario que estudia y busca el uso efectivo de datos, información y conocimiento para la indagación científica, solución de problemas, toma de decisiones para mejorar la salud humana (Shortliffe) La IB desarrolla y aplica teorías para la generación, almacenamiento y uso de información y conocimiento biomédicos. La IB aporta y potencia la ciencia y tecnología de la computación para su aplicación en medicina. Bioinformática: la molecular, aplicada a la genómica. Informática médica: informática clínica. Informática en salud: informática clínica (individuos) más salud pública (poblaciones y sociedades) INFORMÁTICA BIOMÉDICA: incluye a todas las anteriores más Informática de imagen (tejidos y órganos). La IB tiene límites indefinidos, tiene múltiples áreas de aplicación en la atención de la salud    

Sistema de imágenes digitales. Sistema de información de laboratorios clínicos y de investigación Expediente clínico electrónico Telemedicina

El 21 de septiembre de 2011 se aceptó a la IB como una nueva especialidad clínica. CAPÍTULO SEGUNDO. Datos en medicina: su adquisición, almacenamiento y uso. Taxonomía de la información y el conocimiento. La colección, el almacenamiento e interpretación de datos son esenciales para la práctica efectiva de la medicina. Este proceso al principio implica el uso de nuestros sentidos (vista, tacto, oído, olfato) y después los instrumentos como exámenes de laboratorio etc. La inadecuada obtención de datos conlleva al riesgo de incurrir en errores y poner en riesgo la vida del paciente. Los médicos son los principales responsables de la obtención de datos al al momento del interrogatorio, examen físico y resultados Taxonomía del continuo datos-información-conocimiento-sabiduría (DICS) Es un modelo conceptual más usado en las publicaciones académicas de información A) Datos en medicina (dato médico):    

Símbolos que representan propiedades de objetos, eventos y su entorno Por sí mismo carece de sentido y valor si no lo procesamos mentalmente Producto de la observación, materia prima de la información Somatometría, signos vitales, edad, resultados de estudio de laboratorio, estado socioeconómico etc.

B) Información.    

Datos+significado Procesamiento de datos con relevancia y propósito En medicina nos permite responder : “qué”, “quién”, “cuándo” y “dónde” Contextualiza los datos para la toma de decisiones, los hace valiosos y útiles.

C) Conocimiento.      

Es necesario interpretar la información, y aplicarla a través del conocimiento para tomar una decisión. Aplicación de datos e información Transforma la información en instrucciones Nos ayuda a responder el “cómo” Síntesis de información de varias fuentes Conocimiento explícito (saber qué) vs conocimiento tácito (saber cómo)

D) Sabiduría.    

Tiene que ver con la intuición, comprensión en interpretación humana Implica un mayor nivel de abstracción Mayor capacidad de ver al horizonte y planear. Basada en juicio ético, experiencia y creencias del idividuo

CAPÍTULO TERCERO. Conceptos esenciales en IB. Las computadoras son una herramienta extraordinaria para la asistencia en la toma de decisiones, productividad e impulso del desarrollo de las tecnologías de información y comunicación (TIC) Hardware y Software: estructura y funcionamiento de las computadoras. Hardware: conjunto de dispositivos conectados físicamente a la computadora o que pueden ser tocados (teclado, monitor, impresora) Software: instrucciones que controlan dichos circuitos La Internet es la interconexión de todas las computadoras de todo el mundo mediante protocolos TIC/IP, encargados de enlazar computadorasy enviar el contenido que se quiere transmitir. Tecnologías de información y comunicación (TIC) Se definen como la agrupación de elementos y técnicas utilizadas en el tratamiento y transmisión de la información. L OMS reconoce el potencial de las TIC para poder lograr una mayor eficacia en los servicios de salud y un mejor acceso a la atención y mejorar la calidad de la tención. Las TIC en el área de la salud. Los profesionales de la salud recurren cada vez más al uso de blogs, facebook y twitter como canales de información. Equipos médicos basados en tecnología de vanguardia y el uso de software especializado en medicina han permitido grandes avances en investigación; permiten modelar y simular procesos biológicos, anatómicos y fisiológicos. Otra aportación consiste en reunir grandes volúmenes de información digitalizada, actualizada, valida y confiable, esto conlleva a la mejor calidad de atención del paciente. Estándares en IB Obtención de información para utilizarla y tomar decisiones acertadas en el momento que se requiera, esta información puede estar almacenada en bases de datos. Son necesarias normas o acuerdos que permitan la codificación adecuada de los datos médicos y la posibilidad de transmitirlos. Hay dos niveles de codificación: la abstracción y la representación. La abstracción implica la exploración e los datos registrados y su asociación con una terminología que lo describa de forma general y breve. La representación busca decodificar tanto detalle como sea posible. Cuando hay dos o más tecnologías, sistemas o componentes tienen capacidad de intercambiar información y usarla, se dice que tienen interoperabilidad. Enfocado a la medicina, según la OMS, un estándar es un modelo, criterio, regla de medida o de requisitos mínimos aceptables para la operación de procesos específicos con el fin de asegurar la calidad en la prestación de los servicios de salud. Organismos de estandarización. Existen diversos organismos de normalización o estandarización. En el campo de la salud la evolución de las normas se ven beneficiadas con estándares que ayudan al médico a mantenerse actualizado.

CIE: publicada en 1992,décima edición en inglés, los términos tienen una estructura jerárquica Grupos relacionados por el diagnóstico (GRD): proporciona un número relativamente pequeño de códigos de la hospitalización y gravedad de la enfermedad. Se basa en los factores que afectan el costo y la duración de la estancia. Clasificación Internacional de la Atención Primaria: publicada por la Organización Mundial de Medicina de Familia, la versión más reciente, ICPC-2 clasifica unos 14oo términos de diagnóstico. Terminología actualizada de procedimientos médicos (CPT): mantenido por la American Medical Associationl, describe los servicios médicos quirúrgicos y de diagnóstico para unificar la información entre médicos, codificadores, pacientes,instituciones. Manual de Diagnóstico y Estadístico de los Trastornos Mentales (DSM): definiciones de trastornos psiquiátricos , incluye los criterios de diagnóstico específico, coordinado con la CIE-10. SNOMED: contiene términos para 344 000 conceptos. Permite agrupar un alto nivel de detalle, descripciones de los conceptos en múltiples idiomas, términos locales, intenta abarcar todo el espectro del control del vocabulario, cada término está definido por sus relaciones con el resto. GALEN: Tiene como objetivo el desarrollo de herramientas y métodos para la construcción y mantenimiento de clasificaciones de procedimientos quirúrgicos. LOINC: estándar universal y una base de datos para la identificación de resultados de laboratorio, que permite el intercambio y almacenamiento de información. Diccionario de Fármacos de la OMS: terminologías públicas y comerciales para representar términos utilizados para prescribir y administrar medicamentos. Proporciona los nombres usados en diferentes países, ingredientes activos y sustancias químicas. Medical Subject Headings: términos que indexan la bibliografía médica mundial, los términos están organizados en jerarquías. DeCS: trilingüe, creado para servir como lenguaje único en la indización de artículos, revistas, libros, informes técnicos para usarse en la búsqueda y recuperación de asuntos de la bibliografía científica en las fuentes de información disponibles en LILACS, MEDLINE y otras. ANSI: organización privada sin fines de lucro responsable de aprobar estándares americanos a nivel nacional Health Level Seven (HL7): crea métodos para la interoperabilidad e intercambio de datos entre sistemas de salud; concentra datos clínicos, administrativos de proveedores, consultores entre otros. Incluye plantillas para la administración de pacientes como los ingresos, egresos y traslados, consultas, informes, observaciones, programación etc. DICOM: Imágenes Dgitales y Comunicación en Medicina., permite la comunicación de diagnóstico, información de tratamientos, imágenes y datos asociados de cualquier tipo. Documento multicapas, en el que cada uno puede integrar diferentes tipos de información, se basa en estándares de la ANSI-HISBBy en cooperación activa con HL7, se emplea en procedimientos radiológicos típicos, cardiología, endoscopía y oftalmología. Capítulo 4. Evaluación de la tecnología en salud Tecnología: es la aplicación de un conjunto de conocimientos organizados, científicos y/o empíricos con el objeto de satisfacer una necesidad determinada. (Burgelman, 2008). Tecnologías en salud: aplicación de conocimientos, teóricos y prácticos, en forma de dispositivos, técnicas, equipos, medicamentos,vacunas, procedimiento y sistemas empleados para resolver problemas de salud y mejorar la calidad de vida. Evaluación de tecnologías en salud: análisis e investigación sistemática de las consecuencias clínicas, sociales, económicas, legales y éticas que se producen a corto, y largo plazos, así como sus efectos directos e indirectos, deseados e indeseados, derivados de la introducción, desarrollo, difusión, vigilancia y uso de una tecnología sanitaria. Esta evaluación nos proporciona información fiable, pertinente, relevante y útil para sustentar las decisiones en las políticas en salud en administración de servicios y la práctica médica. Se evalúa:

-Evaluación clínica (eficacia, efectividad y seguridad) -Impacto económico (costo-efectividad, costo-utilidad, costo-beneficio, minimización de costos) -Impacto organizacional -Consecuencias éticas y sociales Pasos para evaluar: 1. Planteamiento de las preguntas de investigación 2. Diseño de protocolo de estudio 3. Realización de la investigación (determinación de la seguridad y efectividad y evaluación económica, social, organización y ética) 4. Síntesis de información y discusión de resultados 5. Compilación y elaboración del reporte 6. Difusión de los resultados Revisión sistemática de estudios: identificación de estudios relevantes----> análisis crítico de la literatura---> síntesis de la información----> interpretación de resultados El Ciclo de Gartner es una herramienta gráfica de marca desarrollado y utilizado por IT investigación y asesoramiento firma Gartner para la representación de la madurez, la adopción y la aplicación social de las tecnologías específicas. Capítulo 5. Bases de datos y bibliotecas médicas digitales Fuente de información: es una entidad que provee datos. Fuentes primarias: -Son aquellas que contienen la "información original" -Se presentan completas. -Son resultado de la investigación. Ejemplos: libros,artículos de revistas, tesis, informes, normas, fotografías, mapas. Fuentes secundarias: -Contiene información primaria, elaborada sintetizada y reorganizada. -Refieren a fuentes primarias. -Contienen representaciones condensadas de fuentes primarias. Ejemplos: bases de datos como Medline, diccionarios, enciclopedias e índices y resúmenes bibliográficos. Motor de búsqueda: es una plataforma que permite recuperar archivos almacenados en un servidor de internet. Ejemplo: Google o Yahoo. Base de datos: -Es la organización estructurada de un conjunto de información con por lo menos una características en común que hace posible su agrupación. -Permite la recopilación de la información para su posterior recuperación, para lo cual casi siempre ofrece un motor de búsqueda interno que utiliza características especiales de cada referencia bibliográfica con el fin de lograr su rápida y eficaz ubicación. (Castrillón-Estrada 2008). -Son denominadas fuentes secundarias. Ejemplo: Medline Estrategias de búsqueda: -La construcción correcta de la estrategia permite acceder a la información oportuna y eficiente a través de un conjunto de elementos que posibilitan la recuperación selectiva de información en bases de datos y servicios de información.Los principales elementos son: 1.-Problema a resolver 2.-Términos de búsqueda: conceptos que definan el planteamiento. 3.-Operadores: operadores booleanos Operadores Boleanos AND= intersección OR= adición (suma)

NOT= negación Gestores de bibliografía: Facilitan el uso de normas, estilos y otros elementos que intervienen en el proceso de recopilación y organización bibliográficas. También son herramientas académicas y de investigación que ahorran tiempo y facilitan el manejo de recursos de información de forma automatizada. Ejemplo: Mendeley Capítulo 6. Estrategias para recuperar información La recuperación de la información (RI), a veces llamada "búsqueda", es el campo dedicado a la adquisición, organización y búsqueda de la información basada en el conocimiento (Hersh, 2009). Los sistemas de RI almacenan y difunden información basada en el conocimiento, que es la información obtenida y organizada a o artículo de la investigación por observación o experimental. El objetivo de la RI o investigación es encontrar contenido que cumpla las necesidades de información de una persona, como artículos, páginas de internet, imágenes, etc. Metadatos: son "datos acerca de los datos" y describen los componentes del contenido. La RI incluye dos procesos intelectuales: La indexación: es el proceso de asignar metadatos a los elementos del contenido para facilitar su recuperación. La recuperación: es el proceso del usuario que ingresa su consulta y recupera elementos del contenido. La información basada en el conocimiento puede subdividirse en dos categorías: La información basada en el conocimiento primario (o bibliografía primaria): es la investigación original que aparece en revistas, libros, reportes y otros recursos. Este tipo de información presenta el descubrimiento inicial de aspectos de salud, con los datos originales o un nuevo análisis de los datos. La información basada en el conocimiento secundario: consiste en documentos que revisan, concentran o sintetizan la bibliografía primaria. Está incluye información sobre la salud orientada al paciente. Es el tipo de información que los médicos usan con mayor frecuencia. Contenido bibliográfico: incluye lo que por décadas fue la base de los sistemas de RI: base de datos bibliográficas. Este contenido consiste en citas o indicadores referentes a la bibliografía médica, o sea, artículos en revistas. Ejemplo: Medline Contenido de texto completo: versiones en línea de libros o publicaciones periódicas con la información completa. Términos MeSH (Medical Subject Heading): vocabulario controlado de la NLM, se encuentran en inglés y son los más relevantes al contenido de un artículo. MEDLINE: base de datos de citas y resúmenes de artículos de revistas biomédicas. Contiene más de 20 millones de artículos; es una biblioteca gratuita desde el 26 junio de 1997. CAPITULO 7. CIENCIOMETRÍA: IMPLICACIONES PARA LA INFORMÁTICA BIOMÉDICA 

OBJETIVO: Explicar los 3 usos de la Cienciometría en la IB: a) Recuperación de la información, b) Análisis de bibliografía y c) Obtención de nuevo conocimiento biomédico. Aprender la importancia en el uso de los gestores bibliográficos y utilizar Mendeley para generar su biblioteca personal.



DESARROLLO:

Metadatos: Datos sobre los datos que ayudan a la identificación, descripción y localización de algún recurso: Ligas electrónicas, Datos biomédicos (enfermedades, casos clínicos, fármacos), Colecciones digitales, Información geográfica, Citas /Referencias, Datos Bibliográficos (autor, título, palabras clave, revista, volumen), Datos interactivos, Figuras y tablas. Cienciometría: 

Estudio cuantitativo de los metadatos sobre bibliografía especializada en artículos de investigación

(énfasis en la ciencia). 

Aplicaciones de la cienciometría:

1. Recuperación de información médica: Búsqueda de información precisa, relevante para analizarla y resolver un problema médico. 2. Revisiones bibliográficas: Entender las características de un conjunto de bibliografía, artículos de investigación. 3.

Obtención de nuevo conocimiento médico (Generación de otras colecciones bibliográficas): Proceso más complejo de un análisis bibliométrico. Se analizan nuevas relaciones con las ya existentes



CONCLUSIÓN: La Informática Biomédica aprovecha a la cienciometría para:



El análisis cuantitativo de los metadatos de la literatura.



mantenerse actualizado en cuanto a la información más relevante,



generar una colección de literatura digital, analizarla y difundir los resultados.



como un método alternativo para generar nuevo conocimiento, todo esto orientado a la solución de problemas médicos a través de la literatura especializada.

Bibliometría: 

Estudio cuantitativo de bibliografía de documentos.



Aporta métodos, técnicas e indicadores para evaluar comunicación y uso de la información científica y contribuir al análisis y evaluación de la ciencia y la investigación.



Indicadores Bibliométricos: Surgen como instrumento de análisis para medir la producción científica 

Método Bibliométrico: Consta del análisis de los metadatos de los documentos: autor, año, temas, revista, etc.



Tipos de documentos más utilizados en biomedicina: 1. Informe de casos (Case Report): Manifestaciones clínicas y estudios de evaluación que dan lugar a un diagnóstico. 2. Artículo Clásico (Classical article): Versión actual de un artículo impreso anteriormente que marcó un hito en la medicina o ciencia, comentarios que anuncian su reimpresión. 3. Ensayo clínico (clinical trial phase I-IV): Estudio clínico pre-planificado sobre seguridad, eficacia o esquema de dosis en uno o más fármacos concluyendo efectos favorables y desfavorables. 4. Estudio comparativo: Comparación de los resultados para diferentes técnicas. 5. Ensayo clinico controlado: tratamientos de prueba y de control. Tratamientos pueden ser fármacos, dispositivos, medidas de control incluyen dosificación, regímenes. 6. Casos legales: Informes sobre leyes o casos resueltos. 7. Meta-análisis: Estudios que utilizan un método cuantitativo, combinación de los resultados de estudios independientes, síntesis de resúmenes, visión general de ensayos clínicos. 8. Revisión: Artículo publicado después del examen del material, abarca casos clínicos e informes experimentales.

Gestores Bibliográficos: Mendeley.



Facilitar la organización, almacenamiento de la bibliografía personal, institucional o de grupos.



Realiza las func...


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