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SINTESIS DEL RNA La transcripción del DNA= síntesis del RNA -

rRNA: parte del ribosoma, requerido para las proteinas para la síntesis catalítica. tRNA: adaptador molecular entre amino ácidos y mrna. mRNA: lleva la info para síntesis de proteínas. DNATRANSCRIPCIONRNATRADUCCIONPROTEINA La secuencia en el DNA es trancrita a RNA: mismo lenguaje pero diferente escritura, el producto se llama transcript (transcripción) mRNA puede ser considerado como una copia de trabajo de la secuencia original del genoma. Similitudes entre transcripción y replicación

La síntesis del RNA esta llevada a cabo por reacc secuenciales usando dNTPs como sustratos. En cada reacc un ribunucleotido se añade a la cadena polinucleotidica. LA hidrolisis del PPi proporciona la AG necesaria.

RNA n residuos +NTP RNA n+1 + PPi PPi + H202pi

La síntesis del RNA esta catalizada por Rna polimerasa con un mecanismo similar al de la dna polimerasa en dirección 5’3’. Es un proceso molde-directo, siendo el molde una de las cadenas de DNA.

Diferencias entre transcripción y replicación

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Rna polimerasa: no necesita primers no tiene actividad 3’5’ exonucleasa es más lenta tiene mayor tasa de errores

Solo una hebra de DNA es transcribida cada tiempo. Solo algunas secuencias de dna son transcritas (genes). Cada gen se transcribe muchas veces, y no solo una en el periodo de vida. Existen tasas de transcripción para conocer la actividad de cada gen. Debemos saber cuántas veces tiene que transcribirse un gen (dificultad).

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 En cada gene la cadena no-molde se llama: cadena codificante (coding), porque tiene la misma secuencia que el ARN. (+) CADENA 

La cadena molde es la cadena no codificante (non-coding), y se simboliza como (-). En cada gen el primer nucleótido en ser transcrito será el número +1. Las secuencias del ADN por encima del punto de partida (izquierda) tienen valores negativos, y por debajo valores positivos (derecha). Las secuencias son dadas de acuerdo con la cadena no moldes (la de arriba).

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Transcripción procariota: Rna polimerasa Una rna polimerasa sintetiza todos los RNAs Holoenzima: -nucleo: α2,β, β’ ωrna síntesis - σ subunidad (o factor)reconocimiento del promotor σ Subunidad (o factor) Proteína monomerica con actividad helicasa Reconoce secuencias en dsDNA (double-strand) Diferentes tipos, algunos de ellos específicos para determinados genes en respuesta a señales especificas El 70kDa σ factor es el más abundante y menos especifico en e.coli.

Secuencias promotoras -

Secuencias de DNA o elementos por encima del punto inicial de transcripción Tienen posiciones específicas y secuencias consenso Núcleo promotor: TATAAT caja y TTGACA caja

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Reconocimiento del promotor Sigma identifica y une las secuencias del promotor núcleo

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1. INCIACION Transcripción empieza con la separación del DNA debido a σ actividad helicasa Complejo cerradocomplejo abierto Rna polimerasa empieza la síntesis del RNA y libera pequeños fragmentos de RNA Autorización del promotor: σ factor necesita ser liberado para que la elongación pueda empezar. Burbuja de transcripción: dna está separado solo en 17 pares de bases Rna nacientes forman una doble hélice con 8 pares de bases largas del DNA

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Rna existe a través de un canal en RNA polimerasa 2. ELONGACION Nucleótidos son añadidos en una tasa de 50-90nc/sec Topoisomerasas estabilizan la tensión causada por la transcripción Elongación procede con ralentizaciones y detenciones. 3. TERMINACION Ambas transcripciones inicial y final necesitan ser controladas. Las señales de terminación están en el RNA Dos formas de terminación: -RHO factor-independiente termination -RHO factor-dependiente termination Inicio de la transcripción depende de las señales del DNA. La terminación depende de las señales del ARN. RHO factor-independiente termination ALGUNAS SECUENCIAS AL FINAL DE LOS GENES RALENTIZAN LA TRANSCRIPCION Las horquillas se forma en los RNA nacientes debido a la complementariedad de las secuencias. La horquilla desestabiliza la doble hélice y la RNA polimerasa deja el DNA. RHO factor-dependiente termination -rho es un hexámero de subunidades idénticas con actividad helicasa -Rho es un factor unido al sitio RUT en una sola hebra del RNA. - se mueve a lo largo del nuevo rna formado - alcanza la rna polimerasa de pausa y la detiene.

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REGULACION DE LA TRSNCRIPCION EN PROCARIOTAS Regulación común a muchos genes: el operon Nutrientes u otras moléculas tienen un efecto directo en la regulación Pocos elementos promotores y pocas proteínas involucradas Regulación positiva la unión de activadores facilita la transcripción. La señal puede eliminar el activador Regulación negativala unión del represor inhibe la transcripción. La señal molecular causa disociación de la proteína reguladora desde el DNA La señal molecular causa la unión de la proteína reguladora al DNA. La señal puede eliminar la proteína inhibidora. Ej: tryptophan operon: todas las enzimas son responsables de la síntesis. Cuando este es abundante se una a un inhibidor y la transcripción se para.

Transcripción en eucariotas -

tres tipos diferentes de RNA polimeras para la síntesis del mRNA, rRNA,y tRNA. GTFs (factores de transcripción general): cada polimerasa requiere de ellos para reconocer promotores y ser completamente efectivo. Ejemplos de GTFs para RNA polimerasa II inicio de la transcripción

Regulación de la transcripción en eucariotas -

Promotores son más complejos Mas factores de regulatorios de la transcripción y cofactores control de la expresión genética Modificación de la cromatina está involucrado en la regulación transcriptacional. Mecanismos de Regulación positiva son más frecuentes que los de la regulación negativa.

Tratamiento del RNA EN PROCARIOTAS -

En procariotas el RNA es policistronico: una transcripción se procesa para hacer varias moléculas maduras mRNAs es de corta duración y traduce al mismo tiempo que sintetiza

Tratamiento del mRNA EN EUCARIOTAS - en los núcleos mRNAs son enzimáticamente modificadas en 5’ y 3’. - media vida de mRNAs en el citosol depende de estas modificaciones. - la región codificante está organizada en exones e intrones. Los intrones son eliminados por splicing.

Splicing of Mrna -

tiene lugar en el núcleo algunos intrones pueden ser eliminados por un proceso autocatalitico: los nucleótidos en mRNA llevan a cabo la reacción la myoria de intrones requieren de la actividad catalítica de las nucleoproteínas organizadas en un spliceosome. Summary 1. solo algunas regiones del DNA SE transcriben: las regiones promotoras que ayudan a identificar el punto de inicio. 2. En los procariotas hay una única rna polimerasa y diferentes tipos de subunidades S.

3. En eucariotas es más complejos tanto en términos de proteínas involucradas como en la regulación 4. mrna son procesados en los núcleos y os intrones eliminados por splicing en eucariotas....