Zusammenfassung Transkription Prokaryoten und Eukaryonten PDF

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Transkription Prokaryoten...

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Transkription Prokaryoten: Initiation: - RNA-Polymerase lagert sich an irgendeine Stelle schwach an die DNA - Wandert entlang der DNA, bis sie auf eine Promotosequenz stößt - Bindet dort mit hoher affinität - Wichtige Funktion: o Sigma-Untereinheit ▪ Vermittelt spezifische Bindung an Promotor undverhindert Affinität für andere Nucleotidsequenzen - Bindung an Promotor → Bildung eines geshclossenen Promotorkomplexes (DNA liegt als Doppelhelix vor) - Im zweiten Schritt wird DNA-Doppelhelix über einen Abschnitt von 11-12 Nucleotide um dne Transkriptionsstartpunkt entwunden → Entstehung offener Promotorkomplex mit der Transkriptionsblase - RNa-Syntehse beginnt unter Verwendung eines sder beidne Einzelstränge als Matrize - Bildung von Etwa 10 Nucleotide lagner RNA-Abschnitte → sigma-Untereinheit und Core-enzym verlassen den Promotor - Initiationsphase geht in die Elongationsphase über - Torsionsspannungen im DNa-Molekül, die durch Entwindung enstehen, werde ndurch Topoisomerasen verhindert Elongation: - Wiederholung von 3 Reaktionen: 1. Bindung des zum Nucleotid im Matrizenstrang komplementären Nucleosidtriphsophats an das aktive Zentrum der RNA-Polymerase 2. Freisetzen von Pryophosphat und Ausbildugn einer Phosphodiesterbindung zwischen dem 3’OH-Ende der bereits vorhandenen RNA und dem neu hinzutretenden Nucleotid 3. Wanderung der RNA-Polymerase entlang des Matrizenstrangs Während Elongation sind 8-9 Nucleotide der wachsendnen RNA-Kette über H-Bücken mit der DNA verbunden und bilden ein RNA-DNA-Hybrid! Termination: - Komplex aus RNa-Polyermase, RNA und DNA bleibt bei Verzögerungen relativ stabil, am Ende des Gens zerfällt er jedoch - Zwie Arten: o Rho-unabhängige Terminaton: ▪ Ende der RNA-Syntehse wird von einer Signalsequenz auf der DNA bestimmt (Terminator) ▪ „Stem-Loop“-Struktur als Terminator (Folge von GC-Nucleotiden, die nach der Transkription in der soeben synthetisierten RNA zur Ausbildung einer Haarnadelschleife führt, gefolgt von einer Reihe von a- bzw. im Transkript U-Resten) ▪ Sekundärstruktur interagiert mit Enzym und destablisiert zusammen mit Poly(U)-Bereich den Komplex aus Enzym, DNA und RNA → dann zerfällt er o Rho-abhängige Termination:

o Rho-Protein bindet an die mRNA → Termination Transkription bei Eukaryoten: Initiation: - Transkriptionsfaktor TFIID erkennt mit seinem TATA-Box-Bindungsprotein (TBP) und mehreren TBP-assoziierten Faktoren (TAFs) den Promotor - Lagert sich an die TATA-Box - Sukzessive Bindung der generellen Transkriptionsfaktoren (TFIID + TFIIB) an den Promotor und Anlagerung der RNA-Polymerase II → Bildung des geschlossenen Promotorkomplexes (Präinitiationskomplex) (zuletzt bindet TFIIH) - Anlagerung von 5 weiteren GTFs und der RNA-Polymerase II folgt an die basalen Elemente den Kernpromotos, bis der Präinitiationskomplex vollständig ist - Dann muss der zu transkribierende DNA-Einzelstrang für die Polymerase zugänglich gemacht werden - Helikaseaktivtät von TFIIH tritt in Kraft und entwindet die Doppelhelix um den Transkriptionsstartpunkt über einen Abschnitt von nur wenigen Nucleotiden → offener Initationskomplex entsteht - Entwundene DNA-Abschnitt heißt auch Transkriptionsblase - Dort beginnt die RNA-Syntehse (ohne Primer) an einem der beiden DNA-Stränge Elongation: - TFIIH phosphoryliert mit seiner Proteinkinaseaktivtät die RNA-Polymerase II an einem spezifischen Serinrest in er caboxyterminalen Domäne (CTD) ( am C-Terminus) der RNA-Polymerase, leitet so Überang Initiation zu Elongation ein - Phsophorylierung → RNA-Polymerase kann sich von TFIID und übrigen GTFs lösen - Initationskomplex zerfällt und RNA-Polymerase beginnt mit der Synthese der prämRNA. Termination: - Die RNA-Synthese läuft am Ende des Gens mehr oder weniger einfach aus und kommt erst weiter hinter dem letzten Exon zum Stillstand - Steht offenbar mit der Polyadenylierung des 3’OH-Endes des Transkripts in Verbindung...