Diversidad Microbiana En Suelo PDF

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INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONALESCUELA NACIONAL DE CIENCIAS BIOLÓGICASQuímico Bacteriólogo ParasitólogoDepartamento de MicrobiologíaLaboratorio de Ecología MicrobianaPRÁCTICA No. 5. DIVERSIDAD MICROBIANA EN SUELO RIZOSFÉRICO.4QVEquipos No. 4B y 8BDocentes:● Martínez Gómez Irma Gabriela.● Rivera Orduñ...

Description

INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL ESCUELA NACIONAL DE CIENCIAS BIOLÓGICAS Químico Bacteriólogo Parasitólogo Departamento de Microbiología Laboratorio de Ecología Microbiana

PRÁCTICA No. 5. DIVERSIDAD MICROBIANA EN SUELO RIZOSFÉRICO. 4QV1 Equipos No. 4B y 8B

Docentes: ● Martínez Gómez Irma Gabriela. ● Rivera Orduña Flor Nohemí. ● Sánchez Sánchez T. Nidia. ● Wang Hu EnTao.

Alumnos: ● Crespo Sandoval Jessamyn Reyna. ● López Castillo José Alfredo. ● Martínez Meléndez Diego Eduardo. ● Vasquez Franco Bryan Giovanny.

Fecha de entrega: 05 de octubre de 2021.

OBJETIVOS. 1. Determinar la diversidad de algunos grupos microbianos en una muestra de suelo rizosférico. 2. Comparar la diversidad microbiana de diferentes comunidades (muestras de suelo de la práctica de campo) mediante la aplicación de índices de similitud.

RESULTADOS. Tabla 1. % de Humedad de cada una de las muestras de suelo analizadas. Equipo

Estación

Temperatura (°C)

pH

Humedad Pi

Pf

%Humedad

1

1

18

8.4

91.5

91

5

2

2

18

8.6

83.4

82

14

3

3

17

7.8

106.7

104.3

24

4

4

16

8.0

103.4

102.3

11

5

5

19

8.9

86.8

85.5

13

6

6

17

8.4

89.3

88.1

12

7

7

15

7.2

100.4

98.4

20

8

8

16

7.6

85.8

84.3

15

Tabla 2. UFC/g en Base Húmeda y Base Seca de Bacterias Mesofílicas Aerobias. Bacterias Mesofílicas Aerobias (BMA) Equipo

Estación

Placa 1

Placa 2

Prom.

Dilución

UFC/g BH

UFC/g BS

Log UFC/g BS

% Humedad

1

1

218

209

213.5

10-4

2.135x107

2.24x107

7.35

5

2

2

128

124

126

10-4

1.26x107

1.46x107

7.16

14

3

3

147

152

149.5

10-5

1.495x108

1.96x108

8.29

24

4

4

110

98

104

10-5

1.04x108

1.16x108

8.06

11

5

5

126

132

129

10-4

1.29x107

1.48x107

7.17

13

6

6

108

105

106.5

10-5

1.065x108

1.21x107

7.08

12

7

7

268

257

262.5

10-4

2.625x107

3.28x107

7.51

20

8

8

192

195

193.5

10-5

1.935x108

2.27x108

7.35

15

Tabla 3. UFC/g en Base Húmeda y Base Seca de Pseudomonas fluorescentes. Pseudomonas fluorescentes Equipo

Estación

Placa 1

Placa 2

Prom

Dilución

UFC/g BH

UFC/g BS

Log UFC/g BS

% Humedad

1

1

15

13

14

10-3

1.4x105

1.47x105

5.16

5

2

2

28

32

30

10-4

3.0x106

3.48x106

6.54

14

3

3

18

23

20.5

10-3

2.05x105

2.69x105

5.29

24

4

4

9

6

7.5

10-3

7.5x104

8.42x104

4.92

11

5

5

16

14

15

10-4

1.5x105

1.72x105

5.23

13

6

6

39

42

40.5

10-4

4.05x106

4.6x106

6.66

12

7

7

9

12

10.5

10-3

1.05x105

1.31x105

5.11

20

8

8

17

20

18.5

10-3

1.85x105

2.17x105

5.33

15

Tabla 4. UFC/g en Base Húmeda y Base Seca de Bacillus. Bacillus Equipo

Estación

Placa 1

1

1

5

2

2

3

Placa 2

Prom

Dilución

UFC/g BH

UFC/g BS

Log UFC/g BS

% Humedad

7

6

10-3

6.0x104

6.31x104

4.80

5

18

21

19.5

10-3

1.95x105

2.26x105

5.35

14

3

15

12

13.5

10-3

1.35x105

1.77x105

5.24

24

4

4

4

7

5.5

10-4

5.5x105

6.17x105

5.79

11

5

5

11

9

10

10-4

1.0x106

1.14x106

6.05

13

6

6

15

18

16.5

10-3

1.65x105

1.87x105

5.27

12

7

7

7

9

8

10-3

8.0x104

1.0x105

5.00

20

8

8

19

17

18

10-3

1.8x104

2.11x104

4.32

15

Tabla 5. UFC/g en Base Húmeda y Base Seca de Actinobacterias. Actinobacterias Equipo

Estación

Placa 1

1

1

7

2

2

3

Placa 2

Prom

Dilución

UFC/g BH

UFC/g BS

Log UFC/g BS

% Humedad

6

6.5

10-3

6.5x104

6.84x104

4.83

5

12

15

13.5

10-4

1.35x106

1.56x106

6.19

14

3

24

22

23

10-3

2.3x105

3.02x105

5.48

24

4

4

28

30

29

10-3

2.9x105

3.25x105

5.51

11

5

5

8

10

9

10-4

9.0x105

1.03x106

6.01

13

6

6

16

13

14.5

10-3

1.45x105

1.64x105

5.21

12

7

7

38

35

36.5

10-3

3.65x105

4.56x105

5.65

20

8

8

29

25

27

10-4

2.7x106

3.17x106

6.50

15

Tabla 6. UFC/g en Base Húmeda y Base Seca de Corineformes. Corineformes Equipo

Estación

Placa 1

1

1

5

2

2

3

Placa 2

Prom

Dilución

UFC/g BH

UFC/g BS

Log UFC/g BS

% Humedad

7

6

10-2

6.0x103

6.31x103

3.80

5

14

12

13.5

10-2

1.35x104

1.56x104

4.19

14

3

25

28

26.5

10-2

2.65x104

3.48x104

4.54

24

4

4

18

22

20

10-3

2.0x105

2.24x105

5.35

11

5

5

42

36

39

10-2

3.9x104

4.48x104

4.65

13

6

6

28

23

25.5

10-2

2.55x104

2.89x104

4.46

12

7

7

11

9

10

10-3

1.0x105

1.25x105

5.09

20

8

8

19

21

20

10-2

2.0x104

2.35x104

4.37

15

Fig 1. Representación gráfica de la cuantificación (Log UFC/g (B.S) de suelo de los diferentes grupos microbianos.

Tabla 7. Morfología colonial de los diferentes grupos microbianos. Bacterias Mesofílicas Aerobias

Pseudomonas fluorescentes

Bacillus

Actinobacterias

Corineformes

Color

Blanco

Beige

Crema

Blanco

Morado intenso

Forma

Circular

Circular

Rizoide

Circular

Puntiforme

Bordes

Entero

Entero

Ondulado

Entero

Entero

Elevación

Convexa

Convexa

Plana

Convexa

Convexa

Luz Reflejada

Brillante

Brillante

Mate

Brillante

Brillante

Transparente

Opaca

Opaca

Transparente

Opaca

Lisa

Lisa

Rugosa

Lisa

Lisa

Húmedo

Húmedo

Seco

Húmedo

Húmedo

Suave

Cremosa

Suave y cremosa

Suave

Suave

Sin pigmento difusible

Fluorescente

Sin pigmento difusible

Sin pigmento difusible

Sin pigmento difusible

Característica

Luz Transmitida Superficie Aspecto Consistencia Pigmento difusible

Tabla 8. Coeficiente de similitud de Sorensen. Dendograma. COLONIA

Ecosistema

Σ(+)

1

2

3

4

5

6

7

8

1

+

-

+

-

+

+

-

+

5

2

+

+

-

+

+

+

+

-

6

3

-

+

+

+

-

-

+

+

5

4

+

-

+

+

-

+

+

+

6

5

+

-

+

-

+

+

-

+

5

6

-

+

-

+

-

+

+

-

4

7

-

+

+

+

+

+

+

+

7

8

+

+

-

-

+

-

+

+

5

Coeficiente de Sorensen. 𝐶𝑠 = 2𝑐 / 𝑎 + 𝑏 Comparación de los ecosistemas 1 y 2: 𝑎 = 5, 𝑏 = 6, 𝑐 = 3 Aplicando el coeficiente de Sorensen: 𝐶𝑠 = 2𝑐 / 𝑎 + 𝑏 𝐶𝑠 = 2(3) / 5 + 6 𝐶𝑠 = 0. 54 Comparación de los ecosistemas 2 y 3: 𝑎 = 6, 𝑏 = 5, 𝑐 = 3 Aplicando el coeficiente de Sorensen: 𝐶𝑠 = 2𝑐 / 𝑎 + 𝑏 𝐶𝑠 = 2(3) / 6 + 5 𝐶𝑠 = 0. 54 Comparación de los ecosistemas 3 y 4: 𝑎 = 5, 𝑏 = 6, 𝑐 = 4 Aplicando el coeficiente de Sorensen: 𝐶𝑠 = 2𝑐 / 𝑎 + 𝑏 𝐶𝑠 = 2(4) / 5 + 6 𝐶𝑠 = 0. 72 Comparación de los ecosistemas 4 y 5: 𝑎 = 6, 𝑏 = 5, 𝑐 = 4 Aplicando el coeficiente de Sorensen: 𝐶𝑠 = 2𝑐 / 𝑎 + 𝑏 𝐶𝑠 = 2(4) / 6 + 5 𝐶𝑠 = 0. 72

Comparación de los ecosistemas 5 y 6: 𝑎 = 5, 𝑏 = 4, 𝑐 = 1 Aplicando el coeficiente de Sorensen: 𝐶𝑠 = 2𝑐 / 𝑎 + 𝑏 𝐶𝑠 = 2(1) / 5 + 4 𝐶𝑠 = 0. 2 Comparación de los ecosistemas 6 y 7: 𝑎 = 4, 𝑏 = 7, 𝑐 = 4 Aplicando el coeficiente de Sorensen: 𝐶𝑠 = 2𝑐 / 𝑎 + 𝑏 𝐶𝑠 = 2(4) / 4 + 7 𝐶𝑠 = 0. 72 Comparación de los ecosistemas 7 y 8: 𝑎 = 7, 𝑏 = 5, 𝑐 = 4 Aplicando el coeficiente de Sorensen: 𝐶𝑠 = 2𝑐 / 𝑎 + 𝑏 𝐶𝑠 = 2(4) ÷ 7 + 5 𝐶𝑠 = 0. 6

E1

E2

E3

E4

E5

E6

E7

E8

E1

-

-

-

-

-

-

-

-

E2

0.52

-

-

-

-

-

-

-

E3

0.4

0.545

-

-

-

-

-

-

E4

0.72

0.6

0.72

-

-

-

-

-

E5

1

0.54

0.4

0.72

-

-

-

-

E6

0.2

0.8

0.6

0.6

0.22

-

-

-

E7

0.6

0.76

0.83

0.76

0.6

0.72

-

-

E8

0.6

0.72

0.6

0.54

0.6

0.44

0.66

-

E1E5

E2

E3

E4

E6

E7

E8

E1E5

-

-

-

-

-

-

-

E2

0.54

-

-

-

-

-

-

E3

0.4

0.54

-

-

-

-

-

E4

0.72

0.66

0.72

-

-

-

-

E6

0.22

0.8

0.66

0.6

-

-

-

E7

0.66

0.76

0.83

0.76

0.72

-

-

E8

0.6

0.72

0.6

0.54

0.44

0.66

-

E3E7

E1E5

E2

E4

E6

E8

E3E7

-

-

-

-

-

-

E1E5

0.53

-

-

-

-

-

E2

0.65

0.54

-

-

-

-

E4

0.74

0.72

0.66

-

-

-

E6

0.69

0.22

0.8

0.6

-

-

E8

0.63

0.60

0.72

0.54

0.54

-

E2E6

E3E7

E1E5

E4

E8

E2E6

-

-

-

-

-

E3E7

0.67

-

-

-

-

E1E5

0.38

0.53

-

-

-

E4

0.63

0.74

0.72

-

-

E8

0.58

0.63

0.6

0.54

-

E3E4E7

E2E6

E1E5

E8

E3E4E7

-

-

-

-

E2E6

0.66

-

-

-

E1E5

0.59

0.38

-

-

E8

0.60

0.58

0.6

-

E2E3E4E6E7

E1E5

E8

E2E3E4E6E7

-

-

-

E1E5

0.51

-

-

E8

0.59

0.60

-

E1E5E8

E2E3E4E6E7

E1E5E8

-

-

E2E3E4E6E7

0.53

-

DISCUSIÓN. En la tabla de % de humedad se puede observar que el pH de las diferentes estaciones tiene poca variación. En cuanto a la temperatura, no se presentaron grandes variaciones de valores, lo que favorece el desarrollo de los diferentes tipos de microorganismos presentes en el suelo. Con respecto al pH se notó una variación notable entre las distintas estaciones, teniendo valores desde un 5% a un 25%, lo que nos dicen estos valores, es que a menor cantidad de humedad, habrá menor cantidad disponible para el desarrollo de los microorganismos, pero también, una cantidad en exceso de % de humedad, nos limita e la cantidad de oxígeno disponible, favoreciendo un ambiente ideal para microorganismo anaerobios En la tabla número 2, de bacterias mesofílicas aerobias podemos observar que el % de humedad varía en demasía en las diferentes estaciones, propiciando que la cantidad de microorganismos se encuentren en mayor o menor cantidad en las estaciones, tenemos que la estación con menor número de microorganismos sea la estación número 4, mientras que la estación número 7 es la que presenta mayor cantidad de microorganismos, teniendo uno de los % de humedad más alto dentro de las estaciones (20%). Siendo éstos el grupo microbiano que más predomina, teniendo valores ...