TD5 microbiologie Etude morphologique des colonies bacteriennes sur milieux de culture 2LMD Sci bio. G3, 4, 5, 6 Eco. G1, 2 Benabdellah PDF

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TD 5

Etude morphologique des colonies bactériennes sur milieux de culture

Etude morphologique des colonies bactériennes sur milieux de culture. Introduction La première étape du diagnostic bactérien et du biotypage d’une souche est la description macroscopique des colonies isolées ; parfois cette seule étude permet de connaître le germe qu’on a en présence car les colonies sont typiques… L’étude macroscopique des colonies est donc importante. Les termes employés doivent être précis…mais très nombreux… Par souci de simplicité, durant vos travaux pratiques, nous n’utiliserons que les termes les plus couramment employés. Pour cela, nous allons voir les caractères principaux à étudier. 1. Examen macroscopique 1.1. Les cultures bactériennes sur gélose Il s’agit d’un examen à l’œil nu ou à faible grossissement de boites de pétri et de distinguer les caractéristiques d'une colonie : − Forme du relief (élévation) : Plates, surélevées, bombées, semi-bombée, colonies à centre ombiliqué, etc. − Allure des contours : Lisses, réguliers, irréguliers, circulaires, ondulées, dentelés, amiboïdes, etc. − Taille : Elle varie de 1/10e de mm à plus de 1 cm et dépend d’une part de l’espèce bactérienne et d’autre part de la composition du milieu de culture. − Chromogénèse : Couleur du pigment, pigment soluble ou insoluble dans le milieu. − Transparence : Colonies transparentes, translucides, opaques, etc. − La consistance : Colonies à consistance granuleuse ou visqueuse. − Odeur : Présence ou absence d’odeur, essayer d’en déterminer la nature. − Aspect : collant, filamenteux, etc. − Aspect de la surface : C’est un caractère particulièrement important qui sert à différencier les colonies. Il existe donc des colonies lisses, rugueuses, muqueuses, brillantes, sèches, poudreuses, plissées, etc. Les 3 grands types de colonies sont : − − −

Type S (Smooth = lisses) : contours lisses et réguliers, semi-bombée, surface brillantes, crémeuses. Elles sont souvent formées par les germes pathogènes ; Type R (Rough = rugueux) : contours irréguliers, plates rugueuses et mates, sèches. Elles sont constituées généralement par des germes saprophytes ; Type M (Muqueux) : contours lisse et réguliers, très bombées, surfaces très brillantes, filantes.

1.2. Cultures bactériennes en bouillon - Turbidité plus ou moins abondante. - Formation d’une pellicule à la surface du bouillon. - Dépôts de cellules au fond du tube.

2. Comparaison entre les colonies bactériennes et fongiques Les colonies bactériennes et fongiques font référence à l'apparition de bactéries et de champignons sur une gélose solide et nutritive. La morphologie des colonies est le domaine qui étudie les caractéristiques des colonies. 2.1. Colonies bactériennes − Les colonies bactériennes sont une masse de cellules bactériennes divisées à partir d'une bactérie unique sur le milieu solide ; − Toutes les bactéries de la colonie sont génétiquement identiques et peuvent être qualifiées de clones ; − La plupart des colonies bactériennes sont de forme circulaire ou irrégulière ; − Certains d'entre eux sont des actinomycètes filamenteux ou rhizoïdes ; − La plupart des colonies bactériennes sont minuscules (punctiformes) et mesurent moins de 1 mm de diamètre ; − Les colonies ont une marge définie ; − Le microscope peut être utilisé pour observer le bord des colonies bactériennes ; − La couleur de la colonie varie selon les espèces : blancs, chamois, rouges, violets, etc. − La surface des colonies bactériennes peut être lisse, brillante, rugueuse, terne ou rugueuse. − La texture de ceux-ci peut être butyreuse (beurre), visqueuse (colle à la boucle, difficile à enlever), cassante/friable (sèche, cassée) ou mucoïde (collante, semblable à du mucus).

Les colonies bactériennes : Yersinia enterocolitica 2.2. Colonies fongiques − Les colonies fongiques sont soit une masse de cellules de champignons unicellulaires, soit des hyphes fongiques de champignons multicellulaires ; − Les colonies fongiques composées de champignons unicellulaires ressemblent à des colonies bactériennes sur un milieu solide. Cependant, les colonies fongiques constituées de champignons multicellulaires sont floues ; − La forme de ces colonies peut être soit filamenteuse, soit rhizoïde ;

− Les colonies fongiques apparaissent souvent en gris blanchâtre. Ils se transforment en différentes couleurs à partir du centre avec la croissance de la colonie.

Les colonies fongiques : Yarrowia lipolytica 2.3. Similitudes entre les colonies bactériennes et fongiques − − − −

Les colonies bactériennes et fongiques sont les formes de croissance sur gélose nutritive solide ; Ils présentent des caractéristiques spécifiques à l'organisme qui forme la colonie ; La couleur de la colonie dépend du type de microorganisme qui forme la colonie ; Les deux peuvent être utilisés dans l'identification des microorganismes.

Différence entre les colonies bactériennes et fongiques Caractères Définition

Organismes Composition

Taille de la colonie Apparence * Marge Texture Forme * pH

Colonie bactérienne Une masse visible de cellules provenant d'une seule cellule bactérienne Organismes unicellulaires Masse de cellules bactériennes résultant de la division d'une seule bactérie Petites Apparence lisse ou rugueuse marge définie Humides et brillantes Circulaires ou irrégulières Entre 5 et 9 (optimum 7)

Colonie fongique Une masse d'hyphes filiformes Organismes unicellulaires ou multicellulaires Hyphes fongiques produits par une seule spore Grandes Apparence floue Marge filamenteuse Poudreuses filamenteuses ou rhizoïdes. Entre 5 et 6

* différence principale entre les colonies bactériennes et fongiques.

3. Conclusion Les colonies bactériennes sont de petites colonies brillantes, généralement arrondies et constituées d'un clone bactérien. D'autre part, les colonies de champignons sont de grandes colonies floues formées principalement à partir des hyphes de champignons. La principale différence entre les colonies bactériennes et fongiques réside dans la forme et la texture des colonies....