Compattazione DNA e divisione tra eucromatina ed eterocromatina PDF

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appunti di lezione sulla cromatina e le sue due forme: eucromatina ed eterocromatina a sua volta suddivisa in facoltativa e costitutiva (sove si trovano, come sono formate, come agiscono)....

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CROMATINA: LIVELLO DI COMPATTAZIONE DEL DNA La cromatina deriva dalla compattazione di Dna attorno a proteine per creare una struttura di dimensioni abbastanza piccole da rientarre nel nucleo della cellula. Esistono 2 tipi diversi di cromatina ossia: 

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Eucromatina. Sono delle regioni di cromatina con impacchettamento più lasso ed è la maggior parte della cromatina. Contiene DNA trascrizionalmente attivo (è più facile per le proteine della trascrizione accedere al Dna e effettuare trascrizione). Eterocromatina: zone in cui la cromatina è più condensata, fortemente colorata. È diversa dal resto della cromatina e non de condensano alla fine delle telofase. L’eterocromatina comprende due classi. Due classi: - Costitutiva: si trova sempre, in tutte le cellule, nella stessa posizione nella coppia di omologhi. Non viene espressa a causa della sua composizione o meccanismi epigenetici. E’ costituita da DNA satellite, si trovano anche elementi trapsonibili. È presente in tutti i tessuti (stabili), è polimorfica (dimensioni e localizzazione dell’eterocromatina), è colorata con bandeggio. È condensata in modo permanente, pochi geni, replicazione tadiva, DNA mediamente e altamente ripetitivo. È costituita soprattutto da DNA satelliti che sono molti diversi tra specie e specie. Possono costituire da 1 a 66% del genoma (5%), come funzione hanno quella di creare una stabilità del cromosoma. I trascritti quando presente hanno ruolo strutturale: richiamano altre proteine per eterocromatizzare un’altra zona. Hanno anche un ruolo funzionale nella regolazione dell’espressione di alcuni geni. Ricche in AT e DNA iper metilato. Lunghezza tra 150-180\300 pb perché questi elementi si avvolgono intorno ai nucleosomi. È stato misurato che la lunghezza di DNA se fa più avvolgimenti si hanno multipli delle lugnhezze. Ci sono delle famiglie di DNA satellite nella stessa specie e i monomeri sono conservate. DOT-BLOT quantitativo. Ci sono degli elementi di DNA satellite con AT per il 50%. I DNA staellite possono essere comuni a specie filogeneticamente più distanti oppure essere diffusi in un livello tassonomico più alto (phylum). A volte i DNA satelliti possono seguire la filogenesi e possono essere usati per ricostruire la filogenesi degli organismi. Essendo elementi ripetuti in tandem la modalità di diffondersi sono: slittamento della replicazione, meccanismo del cerchio rotante e conversione genica (eterocromatina costitutiva). Un’altra caratteristica di questa eterocromatina è l’evoluzione concertata: se si prendono le seguenze ribosomiali di una specie A e B, allinamento: le sequenze della specie A restano più conservate tra loro e anche in B: all’interno di ogni specie ci sono dei processi di omogenizzazione delle sequenze ripetute in tandem. Quando le unità che formano una famiglia di Dna ripetuto sono messi a confronto le sequenze delle singole unità ripetute risultano molto più simili all’interno di una specie ce tra specie diverse: il processo che porta a omogenizzazione è evoluzione concertata che avviene con i meccanismi descritti prima che permettono la diffusione di quella sequenza e la trasmettono sempre uguale. Esistono più tipi di DNA satellite umano con posizione diversa. - Facoltativa: si trova nelle due conformazioni e dipende dai casi e dai momenti. È presente temporaneamente in alcune cellule, solo su un omologo e la trascrizione è repressa con meccanismi epigenetici.

L’inattivazione parziale di uno dei 2 cromosomi X (corpo di BARR). Può assumere caratteri dell’eucromatina a seconda delle cellule e dello stadio di differenziamento, è più abbondante nelle cellule differenziate che embrionale, inattivazione di geni nelle cellule differenziate, formato da DNA eucromatinico che viene inattivato in modo specifico durante stadi particolari dello sviluppo. L’inattivazione per metilazione con CH3 al carbonio 5 delle citosine si ha metilazione di istone H3 alla lisina 27 (H3K27me)....