Fragmentierung von Proteinen PDF

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Fragmentierung von Proteinen Weil die Sequenzierung auf relative kurze Peptide beschränkt ist, müssen Proteine zur vollständigen Sequenzanalyse fragmentiert werden. Dazu gibt es chemische und enzymatische Methoden, z.B.: • CNBr reagiert ausschliesslich mit der Seitenkette von Methionin und führt zu einer Zyklisierung, die die nachfolgende Peptidbindung spaltet. • Spezifische Proteasen katalysieren die sequenzabhängige Hydrolyse von Peptidbindungen. Das Enzym Trypsin spaltet nur die Peptidbindungen nach Lys oder Arg. Chymotrypsin spaltet nach den aromatischen Aminsäuren Phe, Tyr und Trp. • Die aus der Fragmentierung entstehenden Peptide werden durch Chromatographie getrennt. Überlappungsanalyse Überlappende Teilsequenzen ergeben die Gesamtsequenz: Spaltung mit verschiedenen Reagenzien/Enzymen und Vergleich der Fragmente

Tertiärstruktur Tertiärstruktur ist die räumliche Anordnung sämtlicher Atome der Polypeptidkette. Aus der Analyse von hochaufgelösten Proteinstrukturen (...