Biochemia 2 Kolokwium 2 - II wersja PDF

Preview

Summary

baza...

Description

BIOCHEMIA 2 KOLOKWIUM 2

1.Które z twierdzeń na temat tetrahydrofolianu są prawdziwe? a. b. c. d.

może służyć jako nośnik grupy karboksylowej grup metylowych może służyć jako nośnik grup metylowych może służyć jako nośnik dwutlenku węgla biotyna jest nośnikiem CO2 tetrahydrofolian jest bardziej wydajnym przenośnikiem grup metylowych niż SAM jest mniej wydajnym e. jednostki jednowęglowe, przyłączone do tetrahydrofolianu mogą ulegać przekształceniom jednych w drugie f. służy jako akceptor jednostek jednowęglowych o różnym stopniu utlenienia w reakcjach rozkładu donor w reakcjach biosyntez g. służy jako donor jednostek jednowęglowych o różnym stopniu utlenienia w reakcjach biosyntez h. tetrahydrofolian powstaje w wyniku przeniesienia grupy adenozynowej na metioninę i. może służyć jako nośnik grup formylowych 2. Dopasuj jednostki węglowe do ich przenośników- S-adenozylometioniny (SAM), tetrahydrofolianu (THF) i biotyny (B) a. b. c. d. e. f.

grupa metylowa -CH3 (SAM i THF) grupa metylenowa -CH2- (THF grupa formylowa -CHO (THF)) grupa formiminowa -CHNH (THF) grupa metenylowa -CH= (THF) dwutlenek węgla -CO2 (B)

3. Wskaż, które z poniższych stwierdzeń dotyczących magazynowania glikogenu są prawdziwe a. Glikogen wypełnia prawie całkowicie jądra komórek, które specjalizują się w jego przechowywaniu b. Glikogen jest głównym źródłem energii przechowywanej w mózgu c. Magazynowanie glikogenu odbywa się w cytoplazmie komórek w formie granulek o dużej gęstości d. Glikogen jest przechowywany w mięśniach i w wątrobie e. Podczas głodówki rezerwy glikogenu są wyczerpywanie bardziej gwałtownie niż rezerwy tluszczu 4. Które stwierdzenia na temat regulacji metabolizmu kwasów tłuszczowych są prawdziwe? a. Insulina hamuje syntezę kwasów tłuszczowych, podczas gdy glukagon i adrenalina aktywują (insulina stymuluje, glukagon i adrenalina prowadzą do rozkładu) b. Synteza kwasów tłuszczowych osiąga maksimum przy dostatku węglowodanów, siły redukcyjnej i energii

c. Cytrynian powoduje depolimeryzacje dimerow karboksylazy acetylo-CoA, przez co hamuje syntezę kwasów tłuszczowych (polimeryzacje, stymuluje) d. Karboksylaza acetylo-CoA jest fosforylowana przez PKA, co hamuje aktywność enzymu i wyłącza syntezę kwasów tłuszczowych w warunkach głodu lub stresu e. Cytrynian częściowo znosi hamujący wpływ fosforylacji na aktywność karboksylazy acetylo-CoA f. Cytrynian wzmacnia hamujący wpływ fosforylacji na aktywność karboksylazy acetyloCoA cytrynian wspomaga proces syntezy kwasów tłuszczowych, wiec stymuluje aktywność karboksylazy g. Karboksylaza acetylo-CoA wykazuje najwyższą aktywność kiedy nie jest fosforylowana i w obecności wysokich stężeń cytrynianu h. Karboksylaza acetylo-CoA jest fosforylowana przez kinazę białkową zależną od AMP (PKA) co hamuje aktywność enzymu i wyłącza syntezę kwasów tłuszczowych i. Glukagon i adrenalina hamują syntezę kwasów tłuszczowych podczas gdy insulina stymuluje j. Cytrynian powoduje polimeryzację dimerów karboksylazy acetylo-CoA przez co aktywuje enzym k. Cytrynian odwraca efekt wywoływany przez palmitylo-CoA na karboksylazę acetyloCoA przez co przyspiesza syntezę kwasów tłuszczowych l. Palmitylo-CoA powoduje polimeryzację dimerów karboksylazy acetylo-CoA, co hamuje jej aktywność (powoduje dysocjację włókien karboksylazy do nieaktywnych form dimerycznych) m. Synteza kwasów tłuszczowych osiąga maksimum przy dostatku węglowodanów i niskim ładunku energetycznym komórki (przy wysokim ładunku) n. Synteza kwasów tłuszczowych rozpoczyna się od kondensacji acetylo-CoA i malonylo-CoA (od karboksylacji acetylo-CoA do malonylo-CoA) o. Synteza kwasów tłuszczowych zachodzi w cytozolu (rozkład w mitochondrium) p. Synteza kwasów tłuszczowych zachodzi przez kilka cyklicznie zachodzących reakcji, zwanych beta-oksydacją (są syntezowane w odrębnym szlaku niż beta-oksydacja) q. Karboksylacja acetylo-CoA do malonylo-CoA, która jest decydującym etapem w syntezie kwasów tłuszczowych prowadzi do hydrolizy ATP do AMP. (ATP DO ADP) r. Dekarboksylacja malonylo-ACP napędza syntezę kwasów tłuszczowych s. Acetylo-CoA jest transportowany do miejsca syntezy kwasów tłuszczowych w postaci cytrynianu, co dodatkowo powoduje wytworzenie NADPH w cytoplazmie 5. Wskaż, które z poniższych stwierdzeń poprawnie opisują cykl mocznikowy a. Pozytywnym efektem ubocznym cyklu mocznikowego jest produkcja ATP (powstają: 2ADP, Pi, AMP, PPi) b. Żadna z podanych odpowiedzi nie jest poprawna c. Celem cyklu mocznikowego jest przekształcenie toksycznego dla komórki amoniaku w nietoksyczną glutaminę (powstaje mocznik i ornityna) d. Wyłączenie grupy aminowej jest możliwe dwiema drogami- przez karbamoilofosforan i asparaginian e. Jego intermediatem jest aminokwas nie będący podstawową jednostką budulcową białek (asparaginian) f. Bezpośrednim prekrusorem mocznika jest arginina g. Synteza karbamoilofosforanu jest praktycznie nieodwracalna, ponieważ w jej przebiegu wykorzystywane są dwie cząsteczki ATP

h. Cykl mocznikowy “zazębia się” z cyklem kwasu cytrynowego poprzez fumaran tworzony podczas reakcji katalizowanej przez karbomoilotransferazę ornitynową fumaran powstaje w reakcji katalizowanej przez ligazę argininobursztynianową; w reakcji kat. przez karbamoilotransferazję ornitynową powstaje cytrulina i. Nośnikiem atomów węgla i azotu wchodzących w cykl mocznikowy jest ornityna j. Reakcje, w których powstaje karbamoilofosforan i ornityna zachodzą w matriks mitochondrialnej, natomiast następne reakcje, prowadzące do syntezy mocznika przebiegają w cytozolu (cytrulina, a nie ornityna) k. Synteza karbamoilofosforanu jest praktycznie nieodwracalna, ponieważ w jej przebiegu wykorzystywane są dwie cząsteczki ATP. 6. Wskaż, które ze stwierdzeń poprawnie opisują procesy syntezy i degradacji kwasów tłuszczowych: Wybierz wszystkie poprawne odpowiedzi: a. betaoksydacja może zachodzić przy udziale wolnych reszt acylowych (brak wolnych reszt) b. Kwasy tłuszczowe o długich łańcuchach alkilowych swobodnie dyfundują przez wewnętrzną błonę mitochondrialną (potrzebny jest specjalny mechanizm transportujący) c. Kwasy tłuszczowe o parzystej liczbie atomów węgla są źródłem prekursora glukozy (ssaki nie mogą przekształcać kwasów tłuszczowych w glukozę, ponieważ nie posiadają szlaku bezpośredniej produkcji szczawiooctanu, pirogronianu i innych intermediantów glukoneogenezy z acetylo-CoA) d. Substraty do syntez kwasów tłuszczowych są związane z białkiem transportującymACP ( produkty pośrednie syntezy kwasów tłuszczowych są kowalencyjnie związane z grupą sulfhydrylową białkowego nośnika reszt acylowych ACP) e. W wyniku rozkładu kwasów tłuszczowych wysokoenergetyczne elektrony są uzyskiwane w postaci NADH i FADH2 , natomiast do syntezy kwasów tłuszczowych niezbędny jest NADPH 7. Wskaż, które z poniższych stwierdzeń o chorobie metabolicznej, fenyloketonurii, są prawdziwe Wybierz wszystkie poprawne odpowiedzi: a. Chorobę leczy się przez podawanie dużych ilości fenyloalaniny w diecie (przez podawanie jak najmniejszej ilości, ponieważ fenyloalanina powoduje fenyloketonurię) b. Choroba prowadzi do nagromadzenia się fenyloalaniny w ciele c. Choroba może być powodowana przez niedobór hydroksylazy fenyloalaninowej(Fenyloketonuria spowodowana jest niedoborem enzymu produkowanego w wątrobie, a dokładniej hydroksylazy fenyloalaninowej.) d. Choroba jest powodowana przez brak możliwości syntezy fenyloalaniny e. Choroba może być wywoływana przez niedobór tetrahydrobiopteryny 8. Proszę przyporządkować poniższe aminokwasy jako glukogenne (G), ketogenne (K), lub zarówno jedne jak i drugie (GK): arginina -> G

leucyna -> K izoleucyna -> GK tryptofan -> GK walina -> G fenyloalanina -> GK glutaminian -> G 9. Wskaż, które z poniższych zdań dotyczą arachidonianu. a. Związek ten jest syntezowany w organizmie człowieka. b. Związek ten wchodzi w skład fosfatydyloinozytolu będącego składnikiem błony komórkowej. c. Mewalonian jest prekursorem tego związku. (linolan) d. Związek ten jest nienasyconym kwasem tłuszczowym. (20:4, wielonienasycony) e. Związek ten jest prekursorem hormonów steroidowych. (hormonów ikozanoidowych) 10. Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń, odnoszących się do zredukowanego glutationu są PRAWDZIWE? a. Utrzymuje reszty cysteinowe białek w formie utlenionej. b. Żadna z odpowiedzi nie jest prawdziwa. c. Powstaje z jego utlenionej formy w reakcji katalizowanej przez reduktazę glutationową. d. Ilość zredukowanego glutationu w komórce jest silnie zależna od NADH. (zależna od NADPH) e. Odgrywa dużą rolę w detoksykacji organizmu. f. Glutation to inaczej gamma-glutamylocysteinyloglicyna. 11. Proszę wskazać stwierdzenia, które w sposób PRAWIDŁOWY opisują metabolizm glikogenu: a. Syntaza glikogenu w wątrobie jest aktywowana w wyniku defosforylacji. b. Forma b fosforylazy glikogenowej z wątroby jest aktywowana wysokimi stężeniami AMP, podczas gdy aktywność tego samego enzymu, ale występującego w mięśniach szkieletowych, nie zależy od AMP. Fosforylaza w wątrobie jest niewrażliwa na AMP c. Kinaza fosforylazowa w mięśniach szkieletowych jest aktywowana zarówno przez fosforylację jak i przez związanie jonów wapniowych. d. Glukoza łączy się w wątrobie z formą a w stanie R fosforylazy glikogenowej hamując jej aktywność. e. Syntaza glikogenu w mięśniach jest aktywowana w wyniku wiązania jonów wapnia (w wyniku defosforylacji) f. Glukozo-6-fosfataza mózgowa jest ważnym enzymem syntetyzującym glukozę z glukozo-6-fosforanu, co pozwala zastąpić stały dostęp paliwa do tego organu (nie w mózgu tylko w wątrobie) g. Kinaza fosforylazowa w mięśniach szkieletowych jest aktywowana między innymi przez fosforylację

h. Syntaza glikogenu w mięśniach jest aktywowana w wyniku defosforylacji i. Kinaza fosforylazowa w mięśniach szkieletowych jest aktywowana między innymi przez fosforylację 12. Spośród poniższych aminokwasów zaznacz aminokwasy egzogenne: 1. Glicyna 2. Metionina 3. Asparagina 4. Lizyna 5. Fenyloalanina

AMINOKWASY ENDOGENNE

WZGLĘDNIE EGZOGENNE

EGZOGENNE

Mogą być syntezowane przez człowieka.

Mogą być syntezowane przez człowieka z innych aminokwasów egzogennych.

Muszą być dostarczane systematycznie wraz z pożywieniem.

● ● ● ● ● ● ● ●

●

alanina glicyna prolina asparagina kwas asparaginowy kwas glutaminowy glutamina cysteina seryna

● ● ●

arginina tyrozyna histydyna

● ● ● ● ● ● ● ●

fenyloalanina izoleucyna leucyna metionina treonina lizyna tryptofan walina

13. Proszę wskazać, które z następujący stwierdzeń dotyczących syntezy glikogenu są PRAWDZIWE? a. syntaza glikogenu potrzebuje glikogeniny do rozpoczęcia reakcji tworzenia wiązań alfa-1,4-glikozydowych - potrzebuje startera do dodawania reszt glukozowych, b. dzięki rozgałęzieniom tworzonym przez wiązania alfa-1,6-glikozydowe maleje szybkośc reakcji zarówno syntezy jak i degradacji glikogenu - fałsz, bo prędkość wzrasta c. aktywną formą glukozy i syntezie glikogenu, jest glukozodifosforan urydyny d. fosforylacja ma taki sam wpływ na aktywność enzymatyczną syntazy glikogenowej jak i fosforylazy fosforylacja hamuje syntaze, aktywuje fosforylazę e. enzym rozgałęziający jest niezbędny do tworzenia wiązań alfa-1,4-glikozydowych, które stanowią nowe punkty rozgałęzienia w syntetyzowanej cząsteczce glikogenu alfa-1,6 f. Dimer glikogenny jest konieczny do rozpoczęcia syntezy glikogenu, ponieważ każda podjednostka katalizuje przyłączenie ośmiu jednostek glukozy do drugiej podjednostki g. Nowe jednostki są dodawane do końca nieredukującego

h. Nowy punkt rozgałęzienia musi być oddalony o co najmniej cztery reszty od odgałęzienia już istniejącego i. Rozgałęzienie tworzone są przez przeniesienie fragmentu złożonego z czterech jednostek glukozy przenoszone są na koniec redukcyjny min 7 jednostek z łanucha zbudowanego z min 11 jednostek, musi mieć koniec nieredukujący 14. Dopasuj biocząsteczkę do pełnionej przez nią funkcji a. forma octanu transportowana we krwi D-3-hydroksymaślan b. transport reszt acylowych do mitochondrium acylokarnityna/karnityna c. transport acetylo-CoA z mitochondrium do cytoplazmy cytrynian d. aktywna forma octanu do syntezy kwasów tłuszczowych Acetylo-CoA/malonylo-ACP e. aktywowana forma kwasu tłuszczowego acyloadenylan 15. Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń dotyczących proteasomu 26S są prawdziwe a. degraduje substrat białkowy wraz z dołączoną do niego ubikwityną fałsz, ubikwityna nie jest degradowana i ponownie wykorzystana b. proteasom 26S składa się z podjednostki katalitycznej 20S oraz dwóch podjednostek regulatorowych 19S c. podjednostka 19S zawiera sześć różnych ATPaz d. miejsce aktywne znajduje się na zewnętrznej powierzchni proteasomu, aby dostęp do potencjalnych substratów był ułatwiony fałsz, bo wewnątrz e. w wyniku jego działania uwalniane są jedynie wolne aminokwasy najpierw peptydy, potem aminokwasy f. podjednostka 20S zawiera sześć różnych ATPaz podjednostka 19S 16. Ile równoważników cząsteczek ATP może powstać w wyniku całkowitego utlenienia nasyconego kwasu tłuszczowego o 18 atomach węgla? proszę zaokrąglić wynik do liczby jedności 122 17. Ile równoważników cząsteczek NADPH potrzeba, aby zsyntetyzować cząsteczkę kwasu tłuszczowego o 18 atomach węgla z acetylo-CoA? Proszę zaokrąglić liczby do jedności? 16 18. Dopasuj białko motoryczne do pełnionej funkcji: a. Skurcz mięśnia szkieletowego - MIOZYNA b. Ruch wici plemnika - DYNEINY c. Transport pęcherzyków od jądra komórkowego do peryferiów komórki - KINEZYNY d. Ruch wici bakteryjnej - FLAGELLINA 19. Które z poniższych stwierdzeń poprawnie opisują układ motoryczny wici bakteryjnej? Wybierz wszystkie poprawne odpowiedzi: a. Białko CheY jest składnikiem kanału jonowego umożliwiającego napędzanie wici. (białka MotA-MotB i FliG) b. Źródłem siły napędowej dla wici bakteryjnej jest hydroliza ATP. (przepływ protonów) c. Wić jest wydłużana przez przyłączanie flagelliny do jej wolnego końca. d. Źródłem siły napędowej dla wici bakteryjnej jest gradient protonów.

e. Obecność chemoatraktanta w otoczeniu bakterii zmniejsza częstotliwość koziołkowania, przez co komórka bardziej sprawnie porusza się w kierunku rosnącego stężenia związku. 20. Wskaż, które ze stwierdzeń dotyczą alfa-tubuliny(T), a które aktyny (A)? a. filamenty helikalnie superskręcony - AKTYNA A b. mogą występować w formie filamentowej (F) i globularnej(G)- AKTYNA A c. wymaga ATP do utworzenia filamentu- AKTYNA A d. wymaga GTP do utworzenia filamentu- ALFA-TUBULINA T e. filament walcowaty, pusty w środku - ALFA-TUBULINA T 21. Wskaż, które z poniższych stwierdzeń opisują główne funkcje fizjologiczne wolnych kwasów tłuszczowych Wybierz wszystkie poprawne odpowiedzi: 1. służą jako prekursory fosfolipidów i glikolipidów 2. stabilizują strukturę błon biologicznych 3. są prekursorami triacylogliceroli 4. są prekursorami pewnych hormonów i przekaźnikami wewnątrzkomórkowymi 5. służą jako paliwo molekularne 22. Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń dotyczących degradacji białek w komórkach są PRAWDZIWE? a. Jedna cząsteczka białka rekrutuje jedną cząsteczkę ubikwityny (minimum 4) b. Jedna cząsteczka białka rekrutuje minimum 4 cząsteczki ubikwityny c. Funkcję znacznika białek przeznaczonych do degradacji w komórkach eukariotycznych pełni ubikwityna (u prokariotycznych ThiS) d. Ubikwityna przyłącza się kowalencyjnie do reszty histydyny białka przeznaczonego do degradacji za pomocą wiązania izopeptydowego (do reszty cysteiny) e. O okresie półtrwania białek w dużej mierze decydują reszty aminokwasowe występujące na końcu karboksylowym białka (na końcu aminowym) f. O okresie półtrwania białek w dużej mierze decydują reszty aminokwasowe występujące na końcu aminowym białka g. W przyłączeniu ubikwityny do białek biorą udział trzy enzymy: enzym aktywujący ubikwitynę, enzym koniugujący i ligaza ubikwitynowo-białkowa 23. Wskaż, które ze stwierdzeń dotyczą lipazy wrażliwej na hormony: a. Lipaza wrażliwa na hormony jest aktywowana w stanie sytości w celu umożliwienia triacypobierania przez komórkę kwasów tłuszczowych z krwi (w stanie głodu) b. Lipaza wrażliwa na hormony katalizuje rozkład diacylogliceroli do monoacylogliceroli i kwasów tłuszczowych (rozkład triacylogliceroli) c. Jest to enzym trawiący tłuszcze w układzie pokarmowym (enzym uruchamiający triacyloglicerole, przekształca do wolnych kw.tłuszczowych i glicerolu i uwalnia do krwi) d. Jest to enzym ulegający fosforylacji przez kinazę białkową A, co zwiększa jej aktywność

e. Enzym ten jest aktywowany przez ufosforylowaną perylipinę dzięki czemu dochodzi do uwolnienie kwasów tłuszczowych z krwi (ufosforylowana perylipina przekształca kropelki tłuszczu, żeby triacyloglicerole były bardziej dostępne dla lipazy) 24. Które z poniższych stwierdzeń dotyczących triacylogliceroli przechowywanych w tkance tłuszczowej są PRAWDZIWE? a. Ich zapasy są uwalniane m. in. przez adrenalinę i glukagon b. Ich zapasy są uwalniane przez insulinę, adrenalinę, noradrenalinę, adrenokortykotropinę i glukagon (insulina hamuje lipolizę) c. Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe d. Mogą być prekursorami glukozy w glukoneogenezie (nie, bo mogą dostarczać prekrursora glukozy) e. Niski poziom acetooctanu we krwi prowadzi do obniżenia lipolizy w tkance tłuszczowej f. Proces lipolizy inicjuje fosfataza białkowa I, która fosforyluje perilipinę A oraz lipazę wrażliwą na obecności hormonów (lipazy są aktywowane dzięki hormonom, które za pośrednictwem 7TM aktywują cyklazę adenylową-zwiekszone stęzenie ATP stymuluje kinazę białkową A, która aktywuje lipazy przez fosforylację) g. Proces lipolizy inicjuje zależna od hormonów lipaza, która jest aktywowana w wyniku modyfikacji kowalencyjnej - adenylacji (hormony: adrenalina, noradrenalina, glukagon, adrenokortykotropina za pośrednictwem 7ATM aktywują cyklazę adenylanową -> zwiększone AMP stymuluje kinazę białkową, która jest odpowiedzialna za fosforylację lipazy, czyli jej aktywację) h. Są źródłem kwasów tłuszczowych, które mogą być utleniane do CO2 i H2) w celu zapewnienia komórce energii i. Są hydrolizowane do kwasów tłuszczowych i glicerolu 25. Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń dotyczących degradacji aminokwasów w komórkach są PRAWDZIWE: a. Grupy α–aminowe są przekształcane w jony amonowe w procesie deaminacji oksydacyjnej glutaminianu. b. Grupa α–aminowa wielu aminokwasów jest przenoszona na α–ketoglutaran w wyniku czego powstaje glutaminian. c. Seryna i asparaginian ulegają bezpośredniej deaminacji. (seryna i treonina) d. Zwiększenie potencjału energetycznego komórki prowadzi do przyspieszenia degradacji aminokwasów. (nadmiar aminokwasów jest wykorzystywany jako materiał energetyczny) e. Reakcje transaminacji katalizowane przez aminotransferazy są nieodwracalne. (są odwracalne) 26. Z listy umieszczonej poniżej proszę wybrać tylko te procesy, które ZACHODZĄ podczas mechanizmu prowadzącego do suwu motoru miozynowego i w konsekwencji do skurczu mięśnia. Uporządkuj je w kolejności w jakiej następują.

A. Uwolniony zostaje ADP B. Przyłączony ATP jest hydrolizowany przez wolną głowę S1 miozyny powodując zmianę konformacyjną pozwalającą jej na następną interakcję z filamentem cienkim. C. Uwolnienie PPi prowadzi do zmian konformacyjnych subfragmentów S1 w stosunku do aktyny. D. Głowa S1 miozyny, w kompleksie z ADP i Pi, nie jest związana z aktyną. E. ATP wiąże się do głowy S1 miozyny, co prowadzi do szybkiego uwolnienia aktyny. F. Cienki filament zostaje gwałtownie pociągnięty na odległość wynoszącą około 110 Å. G. Uwolnienie Pi prowadzi do zmian konformacyjnych subfragmentów S1 w stosunku do aktyny. H. ATP wiąże się do głowy S1 miozyny, co prowadzi do zwiększenia powinowactwa do aktyny. I. Utworzenie przejściowego kompleksu miozyna-aktyna prowadzi do uwolnienia Pi . c. E - B - D - I - G - F - A 27. Regulacja syntezy cholesterolu przez sprzężenie zwrotne jest kontrolowana na etapie katalizowanym przez: a. reduktazę 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA b. transferazę 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA c. kinazę mewalonianu (Jest to synteza mewalonianu) d. syntetazę pirofosforanu izopentylu (Jest to synteza pirofosforanu izopentylu) e. oksydazę 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA f. transferazę 3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA 28. Proszę wskazać, które z poniższych stwierdzeń o białkach motorycznych są PRAWDZIWE: a. Kinez...