Peptides Moreau-Gaudry (cours) PDF

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UE1!–!cours!13!

Peptides( ! I.! Définitions( ! Ce!sont!des!enchainements(d’AA!liés!entre!eux!par!des!liaisons(peptidiques.! Leur!masse(moléculaire(est(inférieur(à(10(000(Da!(dalton).! On!considère!qu’un!peptide!est!entre(2(et(100(AA.! ! La!condensation!de!la!fonction!COOH!et!NH2,!se!fait!avec!l’élimination(d’une(molécule( d’eau!pour!former!un!dipeptide.! La!liaison(CN!porte!le!caractère!d’une!double(liaison(partielle,!donc!il!y!a!un! phénomène(de(résonance!entre!les!2!formes.!Cette!notion!de!double!liaison!partielle! est!une!structure!rigide,!c’est!donc!une!unité(peptidique(plane(et(rigide.! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! Il!y!a!des!degrés(de(rotation(possible(entre(Cα(et(N(;!et!entre(le(Cα(et(le(C(lié(à(l’O.! Ces!degrés!de!liberté!ont!une!convention!internationale!:!! N! On!parle!d’angle!ϕ!entre!C!et!N! N! On!parle!d’angle!ψ!entre!C!et!CO! ! ! ! ! ! ! ! ! Cas(particulier(de(la(proline(et(sa(structure(secondaire(:(( N(fait(parti(du(cycle,!donc!pour!la!proline,!il!n’y!a!pas(de(degré(de(liberté(de(rotation( entre(le(C(et(N.!Donc!quand!on!a!une!proline,!on!a!un!changement(brutal(de(direction! de!la!chaine.!! ! !

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Les!carbones(α(de(2(AA(successifs!sont!situés!en!position(trans!car!c’est!plus! favorable(énergétiquement.! ! Un!AA!engagé!dans!une!chaine!peptidique!est!appelé!:!résidus.! Par!convention,!on!place!à(gauche((=(extrémité(N(terminal)!le!résidu!ayant!sont! groupement!α!aminé!libre.!Le!dernier!résidu!à(droite!(=(extrémité(C(terminal)!a!son! groupement!COOH!libre.! ! Ces!chaines!s’écrivent!de!différentes!manières!:! N! Nomenclature!en!3(lettres! N! Nom!du!résidu(avec(son(suffixe(–yle! N! Nomenclature!à!une(seule(lettre! ! Un!peptide(régulier!est!lorsqu’on!fait!une!hydrolyse(par(l’acide(chloridrique,!on!va! libérer(uniquement(les(AA(de(série(L!et!aussi!des!structures!particulières.! ! Exemple(:(( L’acide(glutamique!peut!former!un!cycle.!En!effet,!la!chaine(latéral(COOH(va(réagir( avec(le(NH2(du(Cα!;!pour!donner!l’acide(5(pyrrolidone(carboxylique!=!5(oxoproline.! Ceci!se!produit!pour!résister(à(la(dégradation(par(les(protéases!qui!ne!reconnaissent! pas!cette!forme!d’AA.!! On!en!trouve!souvent!en!terminaison!de!chaine!pour!protéger!toute!la!chaine.! ! ! ! ! ! ! ! ! Le!glutathion(réduit!(GNSH)!:!on!n’a!pas(un(peptide(régulier.!! La!cystéine(est(liée(avec(la(fonction(carboxylique!de!la!chaine!latérale.!! C’est!une!liaison(pseudoPpeptidique.! ! ! ! ! ! ! ! ! ! Il!va!former!des!dimères!lorsqu’il!est!oxydé,!par!la!formation!d’un!pont(disulfure.!! ! ! (

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II.! Propriétés(physiques( ! Les(AA(absorbes(dans(les(UV.!Donc!quand!on!a!des!acides!aromatiques,!on!a! absorption!dans!les!UV!de!la!même!manière.! La(solubilité(dans(l’eau(va(être(possible(si(les(chaines(latérales(sont(ionisables.(( ! La!dialyse!est!possible!pour!les!peptides(car(le(poids(moléculaire((7g),!le!système!de!glutathion!est! débordé!et!donc!nous!allons!avoir!une!hépatite(très(grave.!! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! C.! Peptides(hormonaux(hypothalamoPhypophysaire( ! L’hypophyse(est!une!glande(endocrine.!! Elle!est!composée!de!2!lobes!:!! N! Lobe(antérieur(( N! Lobe(postérieur! ! Le!lobe(postPhypophyse!(=!postérieur)!:!! Dans!ce!lobe,!y!sont!sécrétées!2!hormones!:!! N! L’ocytocine!! N! L’hormone(antidiurétique!(=!vasopressine)! La! production! de! ces! hormones! est! sous! le! contrôle! de! cellules( nerveuses! qui! sont! situées! au! niveau! de! l’hypothalamus.! Le! transport! des! hormones! va! suivre! l’axone! des! cellules! nerveuses! jusqu’au! lobe! postérieur! où!elles!sont!sécrétées.!! ! Ces!2!hormones!ont!des!structures(très(voisines.!La(vasopressine(ne(diffère(de( l’ocytocine(que(de(2(résidus.!Les(différences(extrêmement(faibles(vont(donner(des( différences(d’activité(extrêmement(forte.! L’ocytocine!est!sécrétée!au!moment!de!l’accouchement!et!provoque!la!contraction!du! muscle!utérin.! La!vasopressine!a!une!action!antidiurétique!et!va!aussi!augmenter!la!pression!sanguine.! ! Il!y!a!une!modification!terminale!en!COOH,! avec!une!amidation!avec!une!fonction! NH2.! ! ! !

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Le!lobe(antéPhypophyse!(=!antérieur)!:!! Au!niveau!de!l’hypothalamus!sont!sécrétés!2!types!de!peptides!:!! N! Les!libérines(! N! Les!statines! Les!libérines!sont!appelées!également!releasing(factor(ou(hormone! (RF! ou! RH).!! Ils!vont! permettre!la! stimulation!de! l’antéhypophyse!et! donc!la! sécrétion!des! peptides!au!niveau!de!l’antéhypophyse.!! Le! passage! des! facteurs! hormonaux! de! l’hypothalamus! à! l’hypophyse! est! fait! de!manière!différente!que!pour!la!postNhypophyse.!! Les! hormones! libérines! et! statines! (=! inhibiteurs)! sont! acheminées! via! un! système(vasculaire!(=!système(porte)!vers!l’antéNhypophyse.! On!va!avoir!par!la!suite,!une!sécrétion!au!niveau!de!l’hypophyse! antérieur!de! stimulines( (=( trophines)( qui! vont! stimuler( les( glandes( endocrines( périphériques! qui! vont! ensuite! sécréter! les! hormones.! C’est! une! cascade! hormonale.! ! Les!peptides!sécrétés!par!l’hypothalamus!vont!agir! sur!l’antéNhypophyse.! ! Exemple(:(( Le! TRF! (=! TRH)! thyreostimulin! releasing! factor! ou! hormone,!va!stimuler!la!sécrétion!de!la!TSH!qui!elle! va! être! libérée! dans! la! circulation,! et! va! agir! sur! la! glande(tyroïde.! Le( TRF( est( le( plus( petit( peptide( hormonal( qui( existe.!C’est!un!tripeptide.! Sa!structure!est!modifiée!à!ses!2!extrémités!:!! N! Extrémité!NPterminal(:!cyclisation(de( l’acide(glutamique(! N! Extrémité!CPterminal(:!il!y!a!une!amidation! Ces!modifications!servent!à!protéger(le(peptide(de(sa(dégradation!qui!serait!sinon! très!rapide.! ! Le!CRF,!va!agir!sur!la!sécrétion!d’un!très!grand!peptide!(polypeptide)!de!241!résidus,!le! POMC.!Ce!POMC!est!sécrété!sous!la!forme!d’un!précurseur,!de!241!résidus.!Après! clivage,!il!est!capable!de!donner!naissance!à!des!peptides!de!différentes!natures!comme!:! N! L’ACTH!qui!va! avoir! une!fonction! stimulatrice!sur! le!cortex( surrénal!(périphérique)!qui!va!sécréter!le!cortisol.! N! La! LPH,! qui! va! agir! sur! l’adipocyte! et! qui! va! activer! la! lipolyse.!! N! Le!MSH!va!permettre!la!stimulation(et(la(prolifération(des( mélanocytes!qui!sont!des!cellules!pigmentaires!de!la!peau.!! N! Les! MetPenképhaline! et! βPendorphines,! qui! sont! des! peptides!analgésiques,!qui!participent!à!la!réduction(de(la( douleur.! ! Donc!à!partir!d’un!seul!précurseur,!on!obtient!une!quantité!importante!de!peptides!à! actions!hormonales!complètement!différentes.! !

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D.! Peptides(régulant(de(la(glycémie( !! L’insuline,!est!une!hormone!sécrétée!par!les!cellules(β(des(ilots(de(Langerhans!du( pancréas.!Cette!hormone!est!hypoglycémiante,!donc!elle!fait(baisser(la(glycémie.!! Elle!a!également!des!fonctions(anabolisantes.! Sa!structure!est!constituée!de!2(chaines,(A(et(B(unis(par(2(ponts(disulfures.!! Il!y!a!également!un(pont(disulfure(intraPcaténaire(de(la(chaine(A.!! Les!insulines!sont!maturés(par(des(précurseurs.! Il!y!a!tout!d’abord!la!préPproPinsuline!qui!est!une!structure!qui!va!être!acheminée!au! niveau!du!réticulum(endoplasmique!grâce!à!son!peptide(signal,!puis!va!ensuite!être! clivée!et!s’accumuler!sous!la!forme!proPinsuline!dans!des!vésicules(prêts(à(être( sécrétées.(Lorsque!la!glycémie!augmente,!il!va!y!avoir!une!libération!de!cette!insuline.! Pour!donner!l’insuline!mature,!la!proNinsuline!va!donc!être!clivée!et!donner!des! peptides(C!et!les!2!chaines!A!et!B!reliés!par!les!2!ponts!disulfures..( ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! Le!glucagon,!est!produit!par!les!cellules(α(de(Langerhans.!La!sécrétion!est!déclenchée! par!l’hypoglycémie.!C’est!donc!une!hormone!hyperglycémiante.!Elle!est!constituée! d’une(seule(chaine(de(29(résidus.!! Il!y!a!2!formes!immatures!:!! N! La!préPproPglucagon!! N! La!proPglucagon!

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7/7...