Zagadnienia PDF

Preview

Summary

Zagadnienia na egzamin doktorski...

Description

1. SYNTEZA OLIGONUKLEOTYDÓW a) metoda diestrowa b) metoda triestrowa c) synteza na podłożu stałym d) pochodne fosforowe jako „syntony” e) pochodne fosforynowe jako „syntony” f) H-fosfoniany jako „syntony” 2. GRUPY OCHRONNE W CHEMII NUKLEOZYDÓW a) grupy chroniące resztę zasadową  grupy chroniące pozycję O-6 w purynach oraz O-4 w pirymidynach  grupy chroniące funkcję egzoaminową –NH2 b) grupy chroniące funkcje hydroksylowe  grupy chroniące funkcję 5’-OH  grupy chroniące funkcję 2’-OH  grupa chroniąca jednocześnie funkcję 5’-OH i 3’OH 3. METODY IDENTYFIKACJI ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH a) spektrometria mas (MS) b) spektroskopia w podczerwieni (IR) c) spektroskopia w nadfiolecie (UV) d) spektroskopia magnetycznego rezonansu jądrowego (NMR) 4. IZOMERIA a) izomery konstytucyjne  różny szkielet łańcucha  różne grupy funkcyjne  różne położenie grup funkcyjnych  tautomery b) stereoizomery  konfiguracyjne  rotamery  konformacje planarne  konformacje klinalne  konformacje cykloheksanu  konformacyjne  konfiguracja absolutna R-S  konfiguracje cukrów D-L  enancjomery (+/-)  diastereoizomery  cis-trans  E-Z  forma mezo  mieszanina racemiczna c) metody rozdziału enancjomerów d) prochiralność e) stereochemiczny opis reakcji, stereoselektywność, stereospecyficzność f) efekty stereoelektronowe  anomeryczny  gauche g) homotopowość, enancjotopowość, diastereoizotopowość 5. KWASY NUKLEINOWE a) budowa i konformacje DNA b) budowa i rodzaje RNA (mRNA, tRNA, rRNA) c) sekwencjonowanie DNA

d) e) f) g) h) i)

replikacja transkrypcja translacja hydroliza kwasów nukleinowych trwałość nukleozydów właściwości chemiczne nukleozydów  modyfikacje funkcji egzoaminowych  modyfikacje w pozycji 5 cytozyny  modyfikacje grup hydroksylowych w cukrach

6. AROMATYCZNA SUBSTYTUCJA ELEKTROFILOWA a) halogenowanie b) nitrowanie c) sulfonowanie d) acylowanie Friedla-Craftsa e) alkilowanie Friedla-Craftsa f) efekt podstawnikowy 7. AROMATYCZNA SUBSTYTUCJA NUKLEOFILOWA 8. AMINY ALIFATYCZNE I AROMATYCZNE a) zasadowość amin alifatycznych i aromatycznych b) reakcje amin alifatycznych  alkilowanie  acylowanie  eliminacja Hoffmana c) reakcje amin aromatycznych  substytucja elektrofilowa  tworzenie soli arenodiazoniowych  reakcja Sandmeyera 9. ZWIĄZKI HETEROCYKLICZNE a) substytucja elektrofilowa pirolu, furanu, tiofenu b) substytucja elektrofilowa pirydyny c) substytucja nukleofilowa pirydyny d) reakcje pirymidyn e) reakcje triazyn 10. SYNTEZA WIĄZANIA NUKLEOZYDOWEGO 11. METYLACJA DNA a) mechanizm b) metylotransferazy DNA c) inhibitory metylotransferaz DNA 12. EPIGENETYKA 13. TERAPIE GENOWE 14. SPLICING 15. AMINOKWASY, PEPTYDY, BIAŁKA 16. PLURIPOTENCJA I ROŻNICOWANIE KOMÓREK 17. EPICELL...