Cours magistral 1 PDF

Title Cours magistral 1
Course Génétique 1
Institution Université de Lille
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Cours magistral effectué...


Description

PARTIE 2: MICROSCOPIE Rappel : La pétrographie (ou pétrologie) est la description des roches Pour décrire une roche → bien observer *Microscopie : Lames minces de roches observées avec un microscope - Lumière transmise → lumière qui passe au travers de la lame - Lame mince → faites pour obtenir transparence de la roche – Lame mince → épaisseur de 30μm – Concernant les roches sédimentaires, pour la décrire, il faut se baser sur différents caractères (qui sont les mêmes qu'en macroscopie) : -Granulométrie -Nature des grains (ou origine des grains) -Texture -Phase de liaison -Induration de la roche Microscope → observations bcp plus fines → différents détails apparaissent en plus : -Forme des grains -Tri granulométrique -Phases de liaison -Marques de la diagénèse (ensemble de transformation que subit le sédiment après son dépôt) *Utilisation/Principe du microscope Pour les détails concernant -Le microscope de pétrographie -L'interaction des minéraux avec la lumière -VOIR MODULE MINERALO *L'identification des minéraux au microscope Pour les roches sédimentaires, comme pour les autres types de roches, il faut identifier les minéraux qui constituent les grains et phase(s) de liaison A la grande différence des roches endogène, pour les roches sédimentaires il faut voir des minéraux mais aussi des grains (leur minéralogie) et aussi les phases de liaison (ainsi que leur minéralogie) *Critère d'identification des minéraux -Forme → LPNA -Couleur → LPNA -Relief (épaisseur du contour du minéral) → LPNA -Pléochroïsme → LPNA -Présence de clivage → LPNA -Teinte de biréfrungence (couleur du minéral quand il est en LPA) → LPA La teinte de biréfrungence du minéral varie en fonction de l'épaisseur de la lame Les couleurs vont passer de vives à pâles -L'angle d'extinction → LPA

-Macle → LPA Extinction d'un minéral est lié aux propriétés optique d'un minéral Quand les axes optiques sont disposés n'importe comment, la lumière va passer partout, or quand on tourne la platine et que les minéraux sont parallèles, la lumière ne passera plus, dont le minéral va s'éteindre Il y a des minéraux particuliers qui sont tjrs éteint → constitués d'une matière dites isotropes (comme le minéral est traversé par la lumière, en passant en LPA, le minéral reste éteint) Quand on voit avoir à faire à des roches sédimentaires → pas de cristaux automorphe → on ne peut donc pas se baser sur leur forme pour reconnaître les minéraux *Observation d'une lame mince -Au début, on la regarde à l'oeil nu → bien utile dans le cas des roches sédimentaires lorsqu'il y a des gros grains, gros minéraux → permet de se rendre compte de la taille -Ensuite, observer en LPA et LPNA avec le plus faible grossissement et regarder toute la lame *Éléments qui constituent les roches sédimentaires -Grains minéraux → grains constitués d'un minéral (ou d'un cristal) qui sont des grains détritiques arrachés aux roches endogènes Qui dit minéral détritique dit Quartz -Quartz → bordure ext du grain n'est pas énorme, teinte du premier ordre (gris clair jusqu'au gris foncé sinon blanc aussi (en fonction de sa position)) -Feldspath → en LPA, incolore, relief faible, bordure à l'ext comme celle du Quartz, possède un macle Dans une roche sédimentaire, il est très fréquent que les feldspath nous semble un peu gris, terne ... Les lithoclastes → association de plusieurs minéraux différents -Grains polycristallins → un seul minéral mais plusieurs cristaux que l'on distingue en LPA Plusieurs plages avec des gris différents Macle → figure qui apparaissent e suivant les plans de cristallisation des minéraux → se font selon des plans bien rectiligne et parallèle les uns des autres -Biotite → minéral peu présent dans les roches sédimentaires -Muscovite → se retrouve fréquemment dans les roches sédimentaire, est incolore, à un relief qui est faible, présente des formes de baguettes assez fines Se distingue facilement du Quartz, va avoir des couleurs bleu foncé, rose. On trouve le Zircon: minéral → quand ils sont dans des roches magmatique --> dans la biotite → mais qd on est dans des roches magmatique le zricon est réistant et amporté et se trouve dans des roches. Il ont un relief très fort. En LPA → teinte de polarsation de 2° ordre. La couleur n'est pas homogène → qd on a des ziron → on les distaningue par des teinte de couleur en LPA. Glauconie → Minéral non détritique, minéral formant la diagènese, il peut former de grain qui se déposent dans les roches sédimentaire. Possède un vert (vert bouteille), mais peut fluctué en vert pale voir foncé. Cette couleur est tellement prononcé que en LPA la teinte de polarisation de 2° ordre est une teinte masqué → càd la coulr du minéral est forte quon arr pas àvoir les teinte de biréfringence. LA teinte est tellment maquaé que cela part en noir → car couleur est assez forte.

– Les grain non minéraux et phase de liaison: Un grain est généralement consititué de critaux petit, non ditingué les uns des autre ou des cristaux très grand – la calcite → minéral typique du calcaire → la calite est présente dans les grain et/ou les phases de liaison → elle va av un aspect diff en fonction de la taile des cristaux: – qd les cristaux de calcite sont sup à 10µm → c'est sparite → transparente et incolore – qd les cristaux sont inf à 4µM est la micrite → criatux petit qu'on arrive oas à distinguer avec un aspect grisatre → opaque – qd la calcite est inf à 10µ m mais sup à 4µ m est la microsparite: on arr à ditsigguer les critaux mm si il sont petit → elle a une colo intermédiaire pas opaque mais pas transpaent Qd on est en LPA → la calcite posède une biréfringence extrème → donne des couleur très pâle, pastel → ces coul sont associé à des irisation → on a un peu de vert, rose jaune, (un peu de bleu) → on peut avoir de irisation plusieur fois mais teinte pâle. La calcite est avec de teinte de polarsation extrème → peut paraitre beige (non blanc, à la diff du quartz qui est gris de 1° ordre) La calcite → on peut trouver des clivage qui peuvent bien s'exprimer → LPNA → on a des clivages visibles. En LPA → on a des cristaux strié mais on peut croire un macle photosynthétque → cpd → ceci n'existe pas dans la calcite → ce n'est pas du plagioclase → c'est juste que les clivages sont fort - Ensuite, on trouve la dolomite → proche de la calcite. Elle a une biréfringence extrème, mm plus pale que la calcite → donc diff à la reconnaitre → mais on a la forme qui peut être un caract chez la dolomite → il ont une forme de losange Mais les dolomites ne font pas tjr des losange. De plus, pour s'aider à reconaitre des minéraux, on peut utiliser la coloration → notamment l'utilisation de colorant spécifique → donc il existe des coloration spécifique de la dolomite (mais également d'autres minéraux) Pour la dolomite, On en rencontre en phase de liaison – Ensuite, on trouve le Phosphate: On la vois au niv des grain ou phase de liaison. Si c'est phase de liason → on parle de diaphosphaté. Si c'est des grains, on parle de grain phosphaté. Les phosphate peuvent être incolore → mais ils sont souvent jaunâtre, orange rouge ou marron. Ces couleur peuv être pléochronique → les phosphates → sont des minéraux isotrophe → donc ils seront tjr éteints. On passe mtn aux grains: On va s'interesser aux grains qui sont présents au niv des roches sédimentaires. – On comence par des grain carbonatées. Ce sont des grains en calcite → car on a eu la digénèse → on va parler de la texture de ces grain et leur forme: – les oolithes → ont une texture typique → la carct au microcpoe est: la partie centrale → qui est le nucléus qui peut être n'importe quoi --> et autour de lui on trouve des couche concentriques --> c'est le cortex constitué de couche concentrique bien visible. Mais les oolithe peuv avoir des aspect assez diff: – ollithe tangentielle – ollithe radiale → on aura de couche concentrique et un peu rayonnant – oolithe micritisé : à cause de la digènese → donc on peut avoir des couche concentrique mais pas tjr – oolithe dissoute →

cortex dissous avec un trou et où peut se dvl les cristaux d'un ciment quelconque → cortex remplacé par des cristaux de sparite – Les intraclaste → grain carbonaté formé dans les mileiu ou on dépose les sédiment carbonatés → les sédiment s'indure et devient de la roche ap le dépot → s'il est perturbé par temps, trembelemnt de terr → donc on aura des morceaux qui se crée a cause d'une cassure, sur lequel va s'ajouter des élément et devient un intraclaste. Les crière. La taille --> les grain sont assez gros – les bioclastes --> c'est un terme générique qui veut dire un débris de coquille → donc il faut connaitre les coquilles de chaque orga: – les bivalve → huitre, coquile St-Jacque → un oblet plat , allongé de forme concave → coupe dans une coquille d'huitre → qqche de tordu, droite, allongé → donc on a diff coquille de bivalve → leur texture n'est pas tjr la mm → on trouve une sorte de hachure vertical en LPA. Les coquille ne font pas tt les mm coquile avec le mm arangement de cristaux → on trouve bcp d'arrangement différents: – arrangement prismatique – arrangment feuilleté – arrangement lamellaire (un peu comme de chevron) – on peut avoir des cas où l'arrangement à été plus ou moins modifié. La coquille va être dissou → on voit des cristaux de sparite Dans les coquilles de bivalve, on va donc trouver plusieurs couche avec diff arrangements. Les coquilles de bivalves ont tt sorte de texture possible reconnaît par leur forme allonge Ensuite, on trouve des grains qui n'est pas un bioclaste: on parle de grain peloide soit issu precipitation chimique, soit issu de bacterie ou pelote fecale. Texture juste de la micrite. Dans les pelloide, on ne trouve pas de couche concentrique juste une boulette de micrite Ensuite, on trouve des grains gasteropodes: aspect assez variable, aspect depend de la maniere dont la coquille est coupée: -1 er type de coupe: coupe verticale → on a différents etages avec une coquille qui devient de plus en plus pointu. - 2 eme type de coupe: coupe le long d'un etage. On a les murs exterieurs de l'escalier qui vont un rond, l'axe et la marche qd coupe perpendiculaire on une forme plus ou moins arrondi. Dans cas des coquilles de gasteropode a l'origine en aragonite. Elle est géneralment dissoute puis remplie de sparite. Si la paroi est constitue de sparite ceci confirme qu'elle a ete dissoute Ensuite, on trouve les foraminifères: ce sont des animaux qui sont microscopique avec une coquille inferieure a 1 mm, qlq 10 ou 100 aine de microns. Ces foraminifere ont une disposition des loges extremement varié et les cristaux sont tres variés, arrondi, allonge, applati, en forme d'oeuf → loge arrangé comme un gastéropode avec un aspect parfoi fonce ( micrite tres dense ), paroi claire ( cristaux arrangee de maniere perpendiculaire a la paroi ) Ensuite, on trouve les echinodermes → se sont les oursins..... En microscopie, on ne peut pas les rater les debris d'echinoderme, n'importe quelle forme ceux caracteristique → ceux qui ont une forme plus ou moins arrondi avec un point au milieu c'est typique: on parle d'entroque. On trouve:

- aspect mouchetee, pas limpide , typique des echinoderme - debris d'echinoderme constitué de monocristaux (qd cristal est allume , allume partout de la meme facon , de meme qd eteint ) → critere fatal → grains : bioclaste issus d'organisme coloniaux Il existe une grande variété d'organisme coloniaux → donc grande variete de texture de forme d'aspect. Dans le cas des bryozoaires → objets allonges un peu strié a l'int. Les bryozoaire sont constitués de matiere assez translucide. Il existe differents types de corail avec une morphologie similaire ou différente. (image de l'immeuble) → forme arrondi Le ciment est de la matière → la lumière passe bien, le ciment paraît transparent de maniere generale. La matrice est sedimentaire → c'est une accumulation de grains plus petits → c'est de la boue quand c'est une matrice carbonatee → les grains sont tellement petit q'on ne les distingue pas → la matrice ressemble a de la micrite. On trouve 2 types de matrice micritique: A gauche sediment grains translucide, ce sont des foraminiferes. Entre ces grains on a de la micrite (blanc → foraminifere) → gris matrice de micrite: dans cette matrice, on trouve un tas de petits grains pas tres net, le contexte de depot est different dans les 2 images: 1) tres fin , calme 2) milieu agite , il y a avec bioclastes , coquille, bioclastes se sont casses , accumulation de morceaux de coquille qui se sont cassées dans la matrice il y a des grains pas si fin On a un sediment avec des foraminiferes de grande taille. On trouve des matrice quartzeuse au milieu de ces grands foraminiferes → (voir nom) La matrice: grande fibre de calcite → ne ressemble pas à la micrite → probablement ciment de calcite On trouve des gres calcareux – gres a ciment calcaire (2eme photo) → on voit des grains : ce sont des grands objets allonges → bivalves On trouve: – des phase de liaisons sombre → laisse peu passer lumiere matrice ; micrite – phase de laisons en calcite : roche carbonatee → pour cela on utilise classif de Dunham : calcaire packstone. → le Folk : calcaire biomicrite → elle construit le nom des roches en utilisant prefix et suffixe Donc, on forme le calcaire en utilisant les 2 classif....


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